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鹅源坦布苏病毒SHYG株E蛋白生物信息学分析
引用本文:邹晓艳,潘金金,宿春虎,管萌,娄亚坤,陈素娟,彭大新,刘秀梵.鹅源坦布苏病毒SHYG株E蛋白生物信息学分析[J].中国家禽,2013,35(17).
作者姓名:邹晓艳  潘金金  宿春虎  管萌  娄亚坤  陈素娟  彭大新  刘秀梵
作者单位:1. 扬州大学兽医学院农业部畜禽传染病重点开放实验室,禽类预防医学教育部重点实验实验室,江苏扬州 225009;光明食品集团上海市川东农场,江苏盐城224100
2. 扬州大学兽医学院农业部畜禽传染病重点开放实验室,禽类预防医学教育部重点实验实验室,江苏扬州 225009
基金项目:公益性行业(农业)专项,江苏省青蓝工程项目,教育部"长江学者和创新团队发展计划"创新团队项目,江苏高校优势学科建设工程
摘    要:为了探索坦布苏病毒E蛋白的抗原结构,以鹅源坦布苏病毒SHYG株E蛋白基因组序列为基础,用DNAStar、Antheprot等软件对E蛋白的二级结构、亲水性、表面可能性、抗原性指数、跨膜结构及等电点等进行预测,用I-TASSER分析E蛋白三级结构.结果表明坦布苏病毒E蛋白等电点为7.15;综合分析显示37~39、80~86、124~126、133~134、233~237、276、315~318、398~399位是可能的B细胞抗原表位,其中80~86、233~237、315~318、398~399位形成抗原表位可能性更高.抗原表位的预测为坦布苏病毒E蛋白的抗原表位的鉴定提供理论依据.

关 键 词:坦布苏病毒  E蛋白  B细胞表位  预测

Bioinformatic Analysis for E Protein of Goose-origin Tembusu Virus Strain SHYG
Abstract:
Keywords:
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