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一个棉花GDSL脂肪酶基因的克隆与功能分析
引用本文:佟祥超,王丽曼,胡文静,张雪颖,张天真,郭旺珍.一个棉花GDSL脂肪酶基因的克隆与功能分析[J].作物学报,2013,39(7):1164-1171.
作者姓名:佟祥超  王丽曼  胡文静  张雪颖  张天真  郭旺珍
作者单位:南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室 / 教育部杂交棉创制工程研究中心, 江苏南京210095
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2011CB109300)资助
摘    要:GDSL脂肪酶与GXSXG脂肪酶是2个重要的脂肪酶亚家族。其中, GDSL家族脂肪酶具有水解酶活性, 能水解多种酯类物质。本试验根据新乡小吉无绒无絮(XinWX)和无绒有絮(XinFLM)近等基因系纤维起始期29K芯片竞争杂交结果, 选择了一个在纤维起始期具有极显著表达差异的EST序列(GenBank登录号为DR458916), 以该序列信息为探针, 利用电子克隆方法并进行cDNA及基因组全长基因PCR扩增、测序验证, 克隆获得一个陆地棉GDSL脂肪酶基因(GhGDSL;GenBank登录号为KC186125)。该基因ORF长1065 bp, 编码354个氨基酸, 含有5个外显子和4个内含子。该基因在二倍体棉种基因组中含一个拷贝, 在四倍体棉种基因组中含2个拷贝。序列比对显示该基因在四倍体棉种的2个亚组中独立进化, 且D亚组比A亚组变异大。染色体定位显示该基因2个拷贝分别位于A4 (Chr. 4)和D4 (Chr. 22)染色体上。定量RT-PCR结果表明, GhGDSL在开花后3~10 d的纤维组织中表达量高, 其中在海7124中表达高峰在8DPA, 在TM-1中表达高峰从5DPA持续到10DPA。利用(TM-1×Hai7124)×TM-1]的BC1S1群体开展GhGDSL功能与纤维、种子品质性状关联分析, 发现该基因A亚组的拷贝与种子脂肪含量存在显著相关(P=0.048);D亚组的拷贝与种子蛋白含量存在极显著相关(P=0.008)。推测GhGDSL基因功能与种子中脂肪、蛋白代谢相关, 同时也参与纤维伸长过程。

关 键 词:GDSL脂肪酶  克隆  表达  基因定位  关联分析  棉花
收稿时间:2012-11-21

Molecular Cloning and Functional Analysis of a GDSL Lipase Gene from Gossypium hirsutum L.
TONG Xiang-Chao,WANG Li-Man,HU Wen-Jing,ZHANG Xue-Ying,ZHANG Tian-Zhen,and GUO Wang-Zhen.Molecular Cloning and Functional Analysis of a GDSL Lipase Gene from Gossypium hirsutum L.[J].Acta Agronomica Sinica,2013,39(7):1164-1171.
Authors:TONG Xiang-Chao  WANG Li-Man  HU Wen-Jing  ZHANG Xue-Ying  ZHANG Tian-Zhen  and GUO Wang-Zhen
Institution:State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Hybrid Cotton R&D Engineering Research Center, Ministry of Education, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China
Abstract:
Keywords:GDSL lipase  Cloning  Expression  Gene mapping  Association analysis  Cotton
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