| 木薯地毯草黄单胞菌转化子T-DNA插入模式分析 |
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| 引用本文： | 张长正,刘进平,时涛,李超萍,陈奕鹏,黄贵修.木薯地毯草黄单胞菌转化子T-DNA插入模式分析[J].热带生物学报,2016(2):246-252. |
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| 作者姓名： | 张长正 刘进平 时涛 李超萍 陈奕鹏 黄贵修 |
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| 作者单位： | 1. 海南大学农学院,海口570228;中国热带农业科学院环境与植物保护研究所,海口571101;2. 海南大学农学院,海口,570228;3. 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所,海口,571101 |
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| 基金项目： | 国家木薯现代产业技术体系建设项目(CARS-12-hnhgx)，2014年海南省研究生创新科研课题(Hys2014-04) |
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| 摘 要： | 随机挑取30个已构建的木薯地毯草黄单胞菌(Xanthomonas axonopodis pv.manihotis)Tn5转化子,利用hi Tail-PCR技术获得Tn5转座子插入位点的侧翼序列64条。其中,有19个转化子获得了插入位点左右两端的侧翼序列,11个转化子获得了单侧侧翼序列。序列分析结果发现,插入位点集中在低GC含量区,特别是49%~50%的区域;Tn5转座子倾向于插入基因编码区内;Tn5转座子的插入会形成9 bp正向重复序列,且插入方向没有偏好性,9 bp正向重复序列的上下游碱基位点中,-5,-2,1,4,5,6,9,11位可能对转座酶的识别起关键作用。
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| 关 键 词： | 木薯 细菌性枯萎病菌 T-DNA插入模式 |
T-DNA Insertion Patterns for the Genome of Xanthomonas axonopodis pv.manihotis Transformants |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Manihot esculenta bacterial blight T-DNA insertion pattern |
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