| 甘蓝ARF基因家族的鉴定与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 卫聪聪,江定,吴根堃,陈长明.甘蓝ARF基因家族的鉴定与生物信息学分析[J].北方园艺,2017(19). |
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| 作者姓名： | 卫聪聪 江定 吴根堃 陈长明 |
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| 作者单位： | 黄河水利职业技术学院,河南开封,475000;华南农业大学园艺学院,广东广州,510642 |
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| 基金项目： | 广东省科技计划资助项目 |
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| 摘 要： | 生长素响应因子(auxin response factor,ARF)基因家族是植物特有的转录因子家族,在调控植物生长发育过程中起重要作用。以公布的甘蓝基因组数据库为基础,采用生物信息学方法鉴定出29个ARF基因,命名为BoARFs,研究分析了其基因结构、染色体分布、蛋白质保守结构域、系统进化树及表达模式,以期为甘蓝ARF基因家族功能的深入研究提供参考依据。结果表明:BoARF家族基因结构相对复杂,含有2~14个外显子;在染色体上呈不均匀分布,除BoARF29基因未定位到染色体上外,其它基因均定位在不同的染色体上;所有BoARF蛋白均具有保守的B3结构域和Auxin_resp结构域,但只有21个BoARF蛋白包含1~2个AUX/IAA结构域;转录组数据表达模式分析表明,ARF基因具有不同的组织表达模式,部分基因表现出组织特异性。
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| 关 键 词： | 甘蓝 ARF 生物信息学 |
Genome-wide Identification and Bioinformatics Analysis of ARF Gene Family in Brassica oleracea |
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| WEI Congcong,JIANG Ding,WU Genkun,CHEN Changming.Genome-wide Identification and Bioinformatics Analysis of ARF Gene Family in Brassica oleracea[J].Northern Horticulture,2017(19). |
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| Authors: | WEI Congcong JIANG Ding WU Genkun CHEN Changming |
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