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天山樱桃EST-SSR引物开发及PCR反应体系优化
引用本文:秦雪,陈淑英,田嘉,李鹏,盛芳,李疆.天山樱桃EST-SSR引物开发及PCR反应体系优化[J].北方园艺,2017(12).
作者姓名:秦雪  陈淑英  田嘉  李鹏  盛芳  李疆
作者单位:1. 新疆农业大学林学与园艺学院,新疆乌鲁木齐,830052;2. 新疆伊犁州林业科学研究院,新疆伊宁,835000
基金项目:国家林业公益性行业科研专项资助项目,新疆维吾尔自治区园艺学重点学科基金资助项目
摘    要:以新疆天山樱桃叶片为试材,从NCBI数据库中搜索天山樱桃EST序列,利用SSRHunter 1.3软件查找SSR位点,结合Primer 6.0设计引物,通过正交实验和单因素试验优化天山樱桃SSR-PCR反应体系,并用最佳体系对所开发的引物进行验证,以期为研究天山樱桃遗传多样性、构建遗传连锁图谱奠定基础。结果表明:从58对备选引物中随机挑选30对引物进行试验,有21对引物能够扩增出特异性条带,有效扩增率为70%。20μL天山樱桃SSR-PCR最佳反应体系为dNTP 0.2mmol·L~(-1)、引物0.4μmol·L~(-1)、Taq酶0.75U、模板DNA 60ng。

关 键 词:天山樱桃  引物开发  EST-SSR  体系优化

Development of EST-SSR Markers and Optimization of SSR System in Cerasus tianschanica
QIN Xue,CHEN Shuying,TIAN Jia,LI Peng,SHENG Fang,LI Jiang.Development of EST-SSR Markers and Optimization of SSR System in Cerasus tianschanica[J].Northern Horticulture,2017(12).
Authors:QIN Xue  CHEN Shuying  TIAN Jia  LI Peng  SHENG Fang  LI Jiang
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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