刺五加转录因子基因的挖掘 |
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引用本文: | 龙月红,宋菊,国红玉,尤鹏升,邢朝斌.刺五加转录因子基因的挖掘[J].北方园艺,2017(20). |
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作者姓名: | 龙月红 宋菊 国红玉 尤鹏升 邢朝斌 |
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作者单位: | 华北理工大学生命科学学院,河北唐山,063000;华北理工大学生命科学学院,河北唐山,063000;华北理工大学生命科学学院,河北唐山,063000;华北理工大学生命科学学院,河北唐山,063000;华北理工大学生命科学学院,河北唐山,063000 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目,河北省教育厅资助科研资助项目,华北理工大学培育基金资助项目 |
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摘 要: | 以刺五加嫩叶为试材,采用二代测序方法Illumina HiSeq 4000进行转录组测序和生物信息学方法,找出其转录因子,并随机挑选4个不同家族的转录因子,针对6个生长时期和3个器官的样本,使用实时荧光定量PCR确认转录因子的正确性。结果表明:刺五加转录组共计8.34Gb,拼接得到77 087条Unigenes,有485个转录因子,分类于36个家族。通过qRT-PCR分析,Unigene 49771、Unigene 22314、Unigene 13139和Unigene18837在不同生长发育时期和器官中表达差异极显著(P0.01)。
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关 键 词: | 刺五加 转录组 转录因子 皂苷 |
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