| 猪瘟病毒四川分离株E2基因克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李琰,谢晶,王秋实,李江凌,廖党金,曹冶,李兴玉,罗丹丹.猪瘟病毒四川分离株E2基因克隆及生物信息学分析[J].广东畜牧兽医科技,2016(3):21-25. |
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| 作者姓名： | 李琰 谢晶 王秋实 李江凌 廖党金 曹冶 李兴玉 罗丹丹 |
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| 作者单位： | 四川省畜牧科学研究院,四川成都,610066 |
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| 基金项目： | 四川省畜牧科学研究院基本科研业务费专项(SASA2013A04)，四川生猪现代产业技术体系疫病控制岗位专项 |
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| 摘 要： | 利用Gen Bank登录的猪瘟病毒(CSFV)参考株(登录号:NC_009089.1)的E2基因序列设计特异性引物,PK-15细胞培养增殖CSFV四川分离株提取RNA,采用RT-PCR技术扩增CSFV疫苗株E2基因,将PCR扩增产物克隆入Pet-32a-BL21载体构建重组质粒门Pet-32a-E2,并进行测序鉴定。测序结果显示,构建的Pet-32a-E2质粒含有1个开放阅读框(ORF),全长1119 bp,共编码373个氨基酸,与Gen Bank登录的CSFV参考株NC_009089.1的E2蛋白的核苷酸同源性为98.8%,氨基酸同源性为98.9%;与石门株兔化弱毒E2蛋白株的核苷酸同源性为94.4%,氨基酸同源性为93.9%。对E2基因及其编码蛋白进行生物信息学分析,结果显示,E2蛋白分子质量为41.6 ku,等电点PI为5.72,是弱酸性蛋白;E2蛋白不含信号肽序列,为可溶性蛋白,有跨膜区,主要定位于细胞质内。通过生物信息学分析预测,为后期CSFV E2蛋白表达,开展蛋白功能研究奠定了基础。
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| 关 键 词： | 猪瘟病毒 E2基因 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of E2 Gene of Classical Swine Fever Virus Isolated from Sichuan Strain |
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