牛和山羊基因组共同加速进化区域与角形成的潜在关系 |
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引用本文: | 李梓锋,殷利夺,刘德武.牛和山羊基因组共同加速进化区域与角形成的潜在关系[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2022,48(5). |
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作者姓名: | 李梓锋 殷利夺 刘德武 |
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作者单位: | 1.华南农业大学动物科学学院,广东 广州 510642;2.中国科学院昆明动物研究所,云南 昆明 650223 |
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基金项目: | 第二次青藏高原综合科学考察研究任务五动物专题(2019QZKK0501) |
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摘 要: | 对14个物种的全基因组序列进行比对,识别其基因组中的同源区域,进而鉴定牛和山羊基因组的共同加速进化区域(以下简称加速区域),并对加速区域进行注释及组蛋白修饰位点的富集分析;运用生物信息学方法,筛选编码区出现加速进化的基因,并对其进行GO和KEGG通路分析。结果表明:在牛和山羊基因组中共检测到44 794个加速区域;加速区域在基因区与非基因区均有分布,分别占总数的54.80%与45.20%;加速区域显著富集了25个不同的组蛋白标记;鉴定出2703个候选基因的编码区出现了加速区域;GO条目分析发现,候选基因主要富集的生物过程包括轴突形成、腺体发育、肌肉组织发育等,细胞组成包括突触膜、轴突部分、突触后致密等;KEGG通路分析发现,这些候选基因参与了cAMP信号通路、轴突导向、钙离子信号通路、Rap1信号通路、神经活性配体–受体互作等信号通路。这揭示在牛角形成过程中,突触和轴突的产生可能发生了独特的变化,影响信号传递与神经结构组成并导致转录调控和基因表达发生变化,从而导致牛科动物出现形态特异的洞角。
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关 键 词: | 牛 山羊 同源区域 共同加速进化区域 角 突触 轴突 |
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