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虾青素法夫酵母β-胡萝卜素转化酶的生物信息学分析
引用本文:张爽,许勇,童琳,张忠东,叶红.虾青素法夫酵母β-胡萝卜素转化酶的生物信息学分析[J].湖北农业科学,2020,59(1).
作者姓名:张爽  许勇  童琳  张忠东  叶红
作者单位:安徽省医学科学研究院,合肥 230061,安徽省医学科学研究院,合肥 230061,安徽省医学科学研究院,合肥 230061,安徽省医学科学研究院,合肥 230061,安徽省医学科学研究院,合肥 230061
摘    要:以虾青素中法夫酵母酶氨基酸序列为研究对象,利用ProtParam、SignalP、PSORT、ProtScale、SOMPA、PredictProtein、PROSITE、COILS和SWISS-MODEL等在线预测工具,对其理化性质、亚细胞定位、亲疏水性、二级结构、三级结构等进行分析。结果表明,该转化酶由557个氨基酸残基构成,是一种无信号肽,具有跨膜结构,定位于细胞色素氧化酶中的可溶性亲水蛋白。α螺旋和无规卷曲为主要的二级结构元件。三级结构以PDB ID 5vcc.1的B链为模板,功能预测为细胞色素P450。生物信息学手段分析预测结果可靠性较高,为进一步研究虾青素的生物合成调控机制提供了理论依据。

关 键 词:虾青素  法夫酵母  β-胡萝卜素转化酶  生物信息学

Bioinformatics analysis of β-carotene converting enzyme (Asy) gene from phaffia rhodozyma
ZHANG Shuang,XU Yong,TONG Lin,ZHANG Zhong-dong,YE Hong.Bioinformatics analysis of β-carotene converting enzyme (Asy) gene from phaffia rhodozyma[J].Hubei Agricultural Sciences,2020,59(1).
Authors:ZHANG Shuang  XU Yong  TONG Lin  ZHANG Zhong-dong  YE Hong
Abstract:
Keywords:
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