| 干旱胁迫和复水处理后梭梭转录因子的转录组分析 |
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| 引用本文： | 何江峰,王力伟,房永雨,王蕴华,王朝,刘红葵.干旱胁迫和复水处理后梭梭转录因子的转录组分析[J].华北农学报,2020,35(1):36-43. |
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| 作者姓名： | 何江峰 王力伟 房永雨 王蕴华 王朝 刘红葵 |
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| 作者单位： | 内蒙古自治区农牧业科学院 生物技术研究中心,内蒙古 呼和浩特 010031,内蒙古自治区农牧业科学院 生物技术研究中心,内蒙古 呼和浩特 010031;内蒙古大学 生命科学学院,内蒙古 呼和浩特 010020,内蒙古自治区农牧业科学院 生物技术研究中心,内蒙古 呼和浩特 010031,内蒙古自治区农牧业科学院 生物技术研究中心,内蒙古 呼和浩特 010031,内蒙古农业大学 生命科学学院,内蒙古 呼和浩特 010010,内蒙古自治区农牧业科学院 生物技术研究中心,内蒙古 呼和浩特 010031 |
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| 基金项目： | 内蒙古自治区自然基金项目;创新基金 |
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| 摘 要： | 为了探明梭梭应对干旱胁迫和水分刺激的分子调控机理,利用高通量测序技术对正常浇水(对照,CK)、干旱胁迫组(轻度干旱胁迫组,LWS;中度干旱胁迫组,MWS;重度干旱胁迫组,SWS)和复水组(RSWS)梭梭的转录组和转录因子表达谱进行分析。结果表明:数据经de novo拼接共获得74 641条非冗余Unigene,N50长度1 537 bp,对转录组数据比对、注释后共检测到56个转录因子家族、1 307个转录因子编码基因。与对照组相比,干旱胁迫组和复水组中的差异表达基因均以下调表达方式为主,其中,AP2-EREBP、MYB、bHLH、WRKY、NAC、ABI3VP1家族基因在各胁迫组中均表达且表达数较多。复水组中偏向通过增加AP2-EREBP、WRKY和NAC家族上调编码基因数量来实现梭梭幼苗对水分刺激的应答调节;而干旱组更偏向下调AP2-EREBP和bHLH的编码基因数量来实现幼苗对干旱胁迫的响应。干旱组和复水组测序结果的表达量(FPKM)与用荧光定量PCR法得到的基因表达量之间的相关性分别为0.947 8(P0.01),0.967 2(P0.01),结果证实了2种处理产生的差异表达基因数据的有效性。综合而言,AP2-EREBP、MYB和bHLH转录因子家族成员对梭梭干旱胁迫具有正负调控的作用。
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| 关 键 词： | 梭梭 转录因子 转录组测序 干旱胁迫 差异表达 |
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