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基于高密度遗传图谱的水稻穗长QTL定位与分析
引用本文:韦敏益,张月雄,马增凤,黄大辉,刘驰,秦媛媛,卢颖萍,鄢柳慧,吴子帅,周小龙,吴旭祥,秦钢.基于高密度遗传图谱的水稻穗长QTL定位与分析[J].华南农业大学学报,2023,44(6):889-895.
作者姓名:韦敏益  张月雄  马增凤  黄大辉  刘驰  秦媛媛  卢颖萍  鄢柳慧  吴子帅  周小龙  吴旭祥  秦钢
作者单位:广西农业科学院 水稻研究所/广西水稻遗传育种重点实验室, 广西 南宁 530007;广西农业科学院 农业科技信息研究所, 广西 南宁 530007;广西农业科学院 柳州分院/柳州市农业科学研究中心, 广西 柳州 545000;广西农业科学院 水稻研究所/广西水稻遗传育种重点实验室, 广西 南宁 530007;广西农业科学院 柳州分院/柳州市农业科学研究中心, 广西 柳州 545000;广东茂名农林科技职业学院, 广东 茂名 525000
基金项目:广西科技计划(桂科AB21220016);广西自然科学基金(2021GXNSFDA075013,2022GXNSFAA035266);广西农业科学院基本科研业务专项及科技发展基金(桂农科2022JM21,桂农科2021JM05,桂农科2021YM04,桂农科2021YT027)
摘    要:【目的】深入挖掘与穗长相关的新基因,为水稻穗长调控的遗传机理研究及分子育种提供依据。【方法】以2个优良亲本‘ZP37’和‘R8605’及其杂交衍生的208个高世代重组自交系(Recombinant inbred lines,RILs)为作图群体,利用全基因组重测序高密度连锁图谱对3个不同环境下的穗长数量性状座位(Quantitative trait locus,QTL)进行定位,同时分析它们的聚合效应。【结果】共检测到11个穗长QTL,分别分布在第3、4、7、8、9和12号染色体上,其似然函数比对数值(Log of odds,LOD)介于3.07~12.87之间,贡献率在2.17%~10.94%之间,有7个QTL是新位点,其余4个QTL位点与已报道的穗长基因和QTL位置重叠或相近。在2个不同环境下重复检测到4个稳定的QTL位点;对聚合了不同数量穗长QTL株系的分析结果表明,穗长QTL表现出累加效应,QTL数量的增加能显著增加水稻穗长。【结论】本研究结果为水稻穗长QTL的克隆和功能解析奠定坚实的基础,为水稻高产育种提供理论依据和遗传资源。

关 键 词:水稻  穗长  QTL定位  高密度遗传图谱
收稿时间:2023/7/10 0:00:00

Detection and analysis of QTL for panicle length in rice using a high-density genetic map
WEI Minyi,ZHANG Yuexiong,MA Zengfeng,HUANG Dahui,LIU Chi,QIN Yuanyuan,LU Yingping,YAN Liuhui,WU Zishuai,ZHOU Xiaolong,WU Xuxiang,QIN Gang.Detection and analysis of QTL for panicle length in rice using a high-density genetic map[J].Journal of South China Agricultural University,2023,44(6):889-895.
Authors:WEI Minyi  ZHANG Yuexiong  MA Zengfeng  HUANG Dahui  LIU Chi  QIN Yuanyuan  LU Yingping  YAN Liuhui  WU Zishuai  ZHOU Xiaolong  WU Xuxiang  QIN Gang
Institution:Rice Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences/Guangxi Key Laboratory of Rice Genetics and Breeding, Nanning 530007, China;Agricultural Science and Technology Information Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences, Nanning 530007, China;Liuzhou Branch, Guangxi Academy of Agricultural Sciences/Liuzhou Research Center of Agricultural Sciences, Liuzhou 545000, China;Rice Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences/Guangxi Key Laboratory of Rice Genetics and Breeding, Nanning 530007, China;Liuzhou Branch, Guangxi Academy of Agricultural Sciences/Liuzhou Research Center of Agricultural Sciences, Liuzhou 545000, China;Guangdong Maoming Agriculture & Forestry Technical College, Maoming 525000, China
Abstract:
Keywords:Oryza sativa L    Spike length  QTL mapping  High-density genetic map
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