| 日本血吸虫期别差异基因的Th细胞表位预测及串连多表位的原核表达 |
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| 引用本文： | 陈进新,苑纯秀,冯新港.日本血吸虫期别差异基因的Th细胞表位预测及串连多表位的原核表达[J].中国兽医寄生虫病,2007,15(5):1-6. |
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| 作者姓名： | 陈进新 苑纯秀 冯新港 |
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| 作者单位： | 1. 上海师范大学生命与环境学院,上海,200234;中国农业科学院上海兽医研究所/农业部动物寄生虫学重点开放实验室,上海,200232
2. 中国农业科学院上海兽医研究所/农业部动物寄生虫学重点开放实验室,上海,200232 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划) |
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| 摘 要： | 目的表达日本血吸虫(Schistosoma japonicum)转录本组中筛选获得的候选抗原基因Th细胞表位,以备免疫试验验证,为建立大规模、高通量、快速鉴定日本血吸虫Th细胞表位的方法奠定基础。方法应用数据挖掘技术,按照序列在不同期别转录本的数量,从Feng L iu等公布的转录本组EST序列中筛选出期别差异表达基因,选择具有完整可读框的序列作为抗原候选基因,其所编码蛋白按照有无信号肽和跨膜结构分为:信号肽跨膜结构组、非信号肽、跨膜结构组序列组。对编码蛋白应用表位预测服务器PRED-BALB/c、SYFPEIT、MHCPred、Rankpep分别对I-Ad、I-Ed、I-Ak、I-Ek型MHC分子进行表位预测。各期别各组筛选出5条最优混合预测表位。选择童虫期信号肽和跨膜结构组(m ep1)和非信号肽、跨膜结构组序列组(m ep2)的各5条最优15肽表位,分别设计并合成其编码核苷酸,克隆到原核表达载体pET-28 a( )进行表达、纯化。结果筛选到不同期别差异表达基因166条。表位预测后,总共筛选出40条最优混合表位,各期别各组5条。将童虫期目的基因m ep1和m ep2成功合成和克隆到了表达载体pET-28 a( ),目的基因m ep1表达量很高,而m ep2未见表达,纯化得到m ep1表达蛋白。结论成功表达了串连抗原表位,为进一步分析其免疫原性、鉴定出有效表位做好了准备。
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| 关 键 词： | 日本血吸虫 转录本组 Th细胞表位 预测 表达 |
| 文章编号： | 1005-0868（2007）04-0001-06 |
| 收稿时间： | 2007-05-17 |
| 修稿时间： | 2007年5月17日 |
T HELPER CELL EPITOPES PREDICTION AND THEIR MULTI-EPITOPES PROKARYOTIC EXPRESSION OF STAGE DIFFERENTIALLY EXPRESSED GENES SCREENED OUT FROM THE TRANSCRIPTOME OF SCHISTOSOMA JAPONICUM |
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| CHEN Jin-xin,YUAN Chun-xiu,FENG Xin-gang.T HELPER CELL EPITOPES PREDICTION AND THEIR MULTI-EPITOPES PROKARYOTIC EXPRESSION OF STAGE DIFFERENTIALLY EXPRESSED GENES SCREENED OUT FROM THE TRANSCRIPTOME OF SCHISTOSOMA JAPONICUM[J].Chinese Journal of Veterinary Parasitology,2007,15(5):1-6. |
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| Authors: | CHEN Jin-xin YUAN Chun-xiu FENG Xin-gang |
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| Institution: | 1.The College of Life and Environment Science;Shanghai Normal University;Shanghai 250014;China;2.Shanghai Veterinary Research Institute;Chinese Academy of Agricultural Sciences;Key Laboratory for Animal Parasitology;Ministry of Agriculture;Shanghai 200232;China |
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| Abstract: | |
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