| 菠萝NAC转录因子基因AcoNAC1生物信息学及表达分析 |
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| 引用本文： | 谭秦亮,蔡元保,杨祥燕,李穆,李季东,黄思婕,程琴,庞新华,朱鹏锦,周全光.菠萝NAC转录因子基因AcoNAC1生物信息学及表达分析[J].热带作物学报,2021,42(2):310-316. |
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| 作者姓名： | 谭秦亮 蔡元保 杨祥燕 李穆 李季东 黄思婕 程琴 庞新华 朱鹏锦 周全光 |
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| 作者单位： | 1.广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西南宁 5300012.广西农垦甘蔗研究所,广西南宁 530001 |
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| 基金项目： | 广西自然科学基金项目(No.2019GXNSFAA245010);广西农业科学院基本科研业务专项(桂农科2020YM55,桂农科2021YT153);广西直属公益性科研院所基本科研业务费专项(桂热研201903)。 |
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| 摘 要： | NAC转录因子作为植物中数量最大的转录因子家族之一,在植物生长发育及各种逆境胁迫中发挥非常重要的调控作用。本研究以菠萝为试验材料,采用RT-PCR技术克隆得到基因AcoNAC1（GenBank登录号：XM_020225830）,对其进行生物信息学及表达分析。生物信息学分析表明,该基因cDNA序列全长1723 bp,ORF为1062 bp,编码353个氨基酸,相对分子量为38.34 kDa,理论等电点为8.88;其编码蛋白的二级结构由20.40%的α-螺旋（H）和15.30%的β-折叠（E）以及59.21%的无规则卷曲（C）组成,具有NAC典型结构保守域。基因表达分析表明,AcoNAC1基因的表达受低温和干旱胁迫诱导,低温胁迫24 h和干旱胁迫12 h时的表达量最高;在不同成熟期品种中表现出持续的诱导表达,但诱导强度逐渐下降,其中早熟品种谢花后20~50 d及晚熟品种谢花后20~60 d基因表达量均处于较高水平。因此,推测AcoNAC1基因可能参与菠萝逆境胁迫响应以及果实发育与成熟的调控。
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| 关 键 词： | 菠萝 NAC转录因子 生物信息学分析 逆境胁迫 |
| 收稿时间： | 2020-04-22 |
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