异常棉NF-YA家族基因鉴定及其在干旱胁迫下的表达分析 |
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引用本文: | 徐珍珍,季为,陈祥龙,徐鹏,郭琪,沈新莲.异常棉NF-YA家族基因鉴定及其在干旱胁迫下的表达分析[J].江苏农业学报,2023(6):1265-1274. |
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作者姓名: | 徐珍珍 季为 陈祥龙 徐鹏 郭琪 沈新莲 |
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作者单位: | 江苏省农业科学院经济作物研究所/农业农村部长江下游棉花与油菜重点实验室 |
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基金项目: | 国家重点研发计划项目(2022YFD1200300);;江苏省重点研发计划项目(BE2022364); |
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摘 要: | NF-YA转录因子在植物生长发育和逆境响应中扮演重要角色。本研究通过生物信息学手段,分析棉花二倍体野生种异常棉基因组中NF-YA家族基因的数目、染色体分布、系统进化、保守基序、结构、顺式作用元件、表达模式及编码蛋白质的亚细胞定位、理化性质等。结果表明,异常棉NF-YA基因家族(GoanoNF-YA)包含17个成员,分布在10条染色体上,编码的蛋白质长度为190~603个氨基酸,理论等电点为7.87~10.07,16个成员包含3~5个外显子且编码的蛋白质定位于细胞核。拟南芥和异常棉NF-YA基因在系统进化树上分为6类,每类基因在系统进化树上具有相同或相似类型和排列顺序的基序。5个NF-YA基因在异常棉根、茎、叶和花中广泛表达,15个NF-YA基因对干旱持续时间有不同程度的响应,11个NF-YA基因含有干旱响应顺式作用元件MBS。本研究结果为进一步解析异常棉NF-YA家族基因的功能提供了理论依据。
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关 键 词: | 异常棉 NF-YA基因家族 生物信息 干旱 表达模式 |
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