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猪流感病毒H1N1亚型济南株HA、NA、NP基因的克隆与序列分析
引用本文:朱晓林,凌宗帅,祝素珍,谢之景,赵宏坤,姜世金,张兴晓.猪流感病毒H1N1亚型济南株HA、NA、NP基因的克隆与序列分析[J].中国兽医学报,2011,31(1).
作者姓名:朱晓林  凌宗帅  祝素珍  谢之景  赵宏坤  姜世金  张兴晓
作者单位:1. 山东农业大学,动物科技学院,山东,泰安,271018
2. 济南出入境检验检疫局,山东,济南,250000
3. 山东省出入境检验检疫局,山东,青岛,266000
基金项目:山东省优秀中青年科学家科研奖励基金资助项目(2008BS07017); 山东出入境检验检疫局科研基金资助项目(SK03-2004)
摘    要:根据GenBank中流感病毒H1N1亚型HA、NA、NP基因序列,分别设计扩增HA、NA、NP基因的特异性引物,用RT-PCR方法扩增猪流感病毒(SIV)H1N1济南株(SW/SD/JT/07)HA、NA、NP基因,分别将RT-PCR产物克隆入pMD18-T载体,进行测序分析。结果显示,SW/SD/JT/07(H1N1)HA基因长为1 701bp,编码566个氨基酸;HA蛋白切割位点为IPSIQSR↓G,属于非高致病性毒株;HA蛋白有8个糖基化位点,其中有6个在HA1蛋白上,有2个在HA2蛋白上,与个别参考毒株糖基化位点个数不同;HA蛋白上的受体结合位点与多数参考毒株一致。SW/SD/JT/07(H1N1)NA基因长为1 410bp,编码469个氨基酸;NA基因颈部未发现氨基酸缺失现象;NA蛋白的头部有5个可能的抗原位点Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ分别由5个区段组成,在340、346、366位分别为P、I、N,其余参考毒株在相应位置的氨基酸分别为S、V、S;NA蛋白共有8个糖基化位点,与个别参考毒株的糖基化个数不同。SW/SD/JT/07(H1N1)NP基因长为1 565bp,编码498个氨基酸,根据HA、NA、NP基...

关 键 词:猪流感病毒  HA基因  NA基因  NP基因  克隆  序列分析  

Cloning and sequence analysis of HA gene,NA gene and NP gene of swine influenza virus H1N1 subtype Jinan strain
ZHU Xiao-lin,LING Zong-shuai,ZHU Su-zhen,XIE Zhi-jing,ZHAO Hong-kun,JIANG Shi-jin,ZHANG Xing-xiao.Cloning and sequence analysis of HA gene,NA gene and NP gene of swine influenza virus H1N1 subtype Jinan strain[J].Chinese Journal of Veterinary Science,2011,31(1).
Authors:ZHU Xiao-lin  LING Zong-shuai  ZHU Su-zhen  XIE Zhi-jing  ZHAO Hong-kun  JIANG Shi-jin  ZHANG Xing-xiao
Institution:ZHU Xiao-lin1,LING Zong-shuai2,ZHU Su-zhen3,XIE Zhi-jing1,ZHAO Hong-kun1,JIANG Shi-jin1,ZHANG Xing-xiao1
Abstract:
Keywords:swine influenza vitus  HA gene  NA gene  NP gene  cloning  sequence analysis  
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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