| 黑木耳18S rDNA序列变异及遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 桂明英,赵春艳,吴素蕊,熊勇,郭相.黑木耳18S rDNA序列变异及遗传多样性分析[J].北方园艺,2014(14). |
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| 作者姓名： | 桂明英 赵春艳 吴素蕊 熊勇 郭相 |
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| 作者单位： | 中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所,云南昆明,650221;云南民族大学,民族药资源化学国家民委-教育部重点实验室,云南昆明650500 |
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| 基金项目： | 科技部科技支撑计划课题资助项目(2013BAD16B01);云南省科技厅对外科技合作计划省院省校科技合作专项资助项目(2012IB008) |
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| 摘 要： | 以黑木耳为试材,利用PCR技术扩增黑木耳18S rDNA序列并测序,再用生物软件Clustalx 2、MEGA 5.1对测序结果进行分析和RNA二级结构预测。根据18S rDNA序列多样性分析和预测的二级结构,研究来自中国东北的5个黑木耳栽培菌株的遗传多样性,以便为黑木耳栽培引种和新品种选育提供参考。结果表明:扩增的18S rDNA序列长度约为1 700bp,去除两端测序质量不好的区域后长度为1 695bp,GC含量为48.02%~48.32%,其核苷酸变异位点25个,信息位点10个,变异位点主要集中在88~107bp区域,N-J系统进化树中5个黑木耳聚为一支,毛木耳单独聚另一支,18S rDNA序列分支与传统的分类结果基本一致;18S rDNA区序列一、二级结构相结合可为黑木耳分类鉴定提供相关的分子结构信息。
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| 关 键 词： | 黑木耳 18SrDNA 遗传多样性 二级结构 |
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