| 青海湖裸鲤盐碱耐受过程中的渗透、免疫、代谢相关基因筛选和分析 |
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| 引用本文： | 张海琛,马清花,许保可,阿琳林,梁健.青海湖裸鲤盐碱耐受过程中的渗透、免疫、代谢相关基因筛选和分析[J].水产学报,2023,47(12):129102-129102. |
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| 作者姓名： | 张海琛 马清花 许保可 阿琳林 梁健 |
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| 作者单位： | 青海大学生态环境工程学院, 省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室, 青海 西宁 810016 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金 (31960741)；青海省科技项目 (2016-ZJ-940Q) |
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| 摘 要： | 为探究青海湖裸鲤在盐碱耐受过程中的基因表达变化，对青海湖河口水域以及入湖淡水河——泉吉河中的青海湖裸鲤的鳃、肾脏组织进行转录组测序，筛选青海湖裸鲤耐盐碱过程中发挥作用的免疫、代谢、渗透相关基因。结果显示，使用Trinity对所有样本质控数据(clean data)进行从头组装后共得到541 429个非冗余的序列(unigene),N50平均长度达612 bp。经差异表达分析发现，共有832个基因在2个区域中的青海湖裸鲤鳃、肾脏中共表达。经GO功能注释分析，注释到结合(binding)、细胞过程(cellular process)、代谢过程(metabolic process)、单一生物过程(single-organism process)的DEGs占比较多。KEGG通路分析结果表明，与免疫、代谢、渗透相关的通路得到了富集。根据差异表达基因的GO注释和KEGG信号通路富集分析，实验初步筛选到了青海湖裸鲤渗透相关基因，主要包括钠/钾转运ATP酶(sodium/potassium-transporting, ATPase)、钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶(calcium/calmodulin-d...
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| 关 键 词： | 青海湖裸鲤 转录组测序 盐碱耐受 差异表达基因 |
| 收稿时间： | 2021/5/7 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2021/10/10 0:00:00 |
Screening and analysis of the osmotic, immune, metabolic related genes of Gymnocypris przewalskii in saline-alkali tolerance |
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| ZHANG Haichen,MA Qinghu,XU Baoke,A Linlin,LIANG Jian.Screening and analysis of the osmotic, immune, metabolic related genes of Gymnocypris przewalskii in saline-alkali tolerance[J].Journal of Fisheries of China,2023,47(12):129102-129102. |
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| Authors: | ZHANG Haichen MA Qinghu XU Baoke A Linlin LIANG Jian |
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| Institution: | State Key Laboratory of Plateau Ecology and Agriculture, College of Eco-Environmental Engineering, Qinghai University, Xining 810016, China |
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