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大球盖菇新品种“中菌金球盖1号”的基因组Survey分析
引用本文:李雪松,刘绍雄,孙达锋,张俊波,马明,罗孝坤,岳万松,华蓉.大球盖菇新品种“中菌金球盖1号”的基因组Survey分析[J].中国食用菌,2022(7):53-58.
作者姓名:李雪松  刘绍雄  孙达锋  张俊波  马明  罗孝坤  岳万松  华蓉
作者单位:1. 云南云菌(集团)有限公司;2. 云南省食用菌产业发展研究院;3. 中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所
摘    要:大球盖菇(Stropharia rugosoannulata)是一种营养丰富、口味鲜美的食用菌,也是极具开发潜力的药用真菌。为了深入对金黄色大球盖菇的子实体发育、颜色调控等遗传机理开展研究,为金黄色大球盖菇基因组的精细图谱、分子育种等研究打下基础,采用第二代高通量测序技术对金黄色大球盖菇品种“中菌金球盖1号”开展全基因组Survey分析。结果表明,金黄色大球盖菇品种“中菌金球盖1号”的基因组大小约为55.20 Mb,测序深度为140×,杂合率为0.80%,(G+C)含量为47.25%;基因组初步组装后,得到25 802条重叠群(Contigs),Contig N50为14.923 Kb。该研究结果对于开展金黄色大球盖菇的颜色调控等遗传机理研究具有重要意义,同时为金黄色大球盖菇下一步的基因组精细图谱的构建和分子育种提供依据。

关 键 词:大球盖菇  基因组survey  杂合率  基因组大小  GC含量
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