| 千金子叶绿体基因组的结构及特征分析 |
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| 引用本文： | 田祥瑞,徐梦彬,王飞,叶凌凤.千金子叶绿体基因组的结构及特征分析[J].杂草科学,2022(2):6-14. |
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| 作者姓名： | 田祥瑞 徐梦彬 王飞 叶凌凤 |
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| 作者单位： | 江苏省农垦农业发展股份有限公司现代农业研究院 |
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| 摘 要： | 千金子是稻田一年生禾本科恶性杂草，已成为威胁水稻生产的优势种群。采用Illumina HiSeq测序及生物信息分析方法对千金子叶绿体全基因组序列进行测定、组装、注释和解析。结果表明，千金子叶绿体基因组全长为135 656 bp, GC含量为38.26%,呈现典型的禾本科植物叶绿体基因组的4段闭合环状结构；其中，大单拷贝区80 843 bp,小单拷贝区12 768 bp,反向重复区42 045 bp;通过功能富集，共获得注释基因131个，包括84个蛋白编码基因、39个tRNA基因和8个rRNA基因；另外，还检测到49条简单重复序列(SSR)和46条长度大于20 bp的重复序列。利用IQTREE软件，基于叶绿体基因组以粳稻为外群构建了25种禾本科杂草的系统进化树，显示出千金子与真穗草属、虎尾草属和狗牙根属杂草具有相对较近的亲缘关系，而3种稗属杂草则与水稻的亲缘关系更近。本研究结果可为千金子的精准识别和分子进化解析提供理论借鉴。
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| 关 键 词： | 千金子 叶绿体基因组 结构特征 功能基因注释 SSR 系统发育进化树 |
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