| 基于RNA-Seq技术分析非致病细胞病变BVDV感染牛单核细胞对NF-κB信号通路的影响 |
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| 引用本文： | 何延华,马旭升,钟发刚,黄新,张云峰,赵新霞,陈创夫.基于RNA-Seq技术分析非致病细胞病变BVDV感染牛单核细胞对NF-κB信号通路的影响[J].动物医学进展,2020(2):39-46. |
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| 作者姓名： | 何延华 马旭升 钟发刚 黄新 张云峰 赵新霞 陈创夫 |
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| 作者单位： | 新疆生产建设兵团动物疾病防控重点实验室;新疆医科大学厚博学院;省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31460663);新疆生产建设兵团动物疾病防控重点实验室开放课题(2016BTDJ05) |
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| 摘 要： | 非致细胞病变(NCP)牛病毒性腹泻病毒(BVDV)可引起持续的潜伏感染和免疫抑制,但是具体的感染机制尚不清楚。采用RNA测序(RNA-seq)技术,以NCP BVDV感染牛单核细胞2h和24h的细胞为样本分别提取总RNA,并采用HiSeqTM2500高通量测序技术进行转录组测序,对获得的有效序列进行功能注释及相关生物信息学分析。结果显示,在感染2h后,筛选出差异表达基因9959个,其中4968基因表达上调;在感染24h后,筛选出差异表达基因7977个,其中4184的基因表达上调;进一步分析NF-κB信号通路的变化,结果显示,在感染后2h,与免疫反应或抗病毒活性相关的基因表达显著增加,到感染24h表达水平显著下降。变化显著的基因均与炎症、免疫、自噬和凋亡密切相关。研究建立的牛外周血单核细胞感染BVDV后差异表达基因数据库,丰富了BVDV与宿主之间的相互关系,为BVDV持续感染机制的研究奠定基础。
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| 关 键 词： | 牛病毒性腹泻病毒 牛单核细胞 核糖核酸测序 核转录因子-κB信号通路 |
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