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| 侵染我国芋的杆状DNA病毒分子鉴定及特异性检测 | |
| 引用本文： | 施世明,王彦芬,王国平,王利平,徐文兴,洪霓.侵染我国芋的杆状DNA病毒分子鉴定及特异性检测[J].植物病理学报,2013,43(6):590-595. |
| 作者姓名： | 施世明 王彦芬 王国平 王利平 徐文兴 洪霓 |
| 作者单位： | 1 华中农业大学植物科技学院，湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室，武汉430070； 2 华中农业大学， 农业微生物学国家重点实验室，武汉430070 |
| 摘 要： | 采用已报道杆状DNA病毒属（Badnavirus）的通用检测引物BadnaFP/BadnaRP，从7份芋样品中扩增到 Badnavirus 病毒的RT/RNase H基因保守区域，获得12个克隆序列，长度为576 bp。序列分析结果显示，来自不同样品的克隆间核苷酸和氨基酸序列相似性分别为78.8%~99.5%和81.3 %~99.5%；来自同一样品扩增产物的克隆间在序列上也存在较大差异，核苷酸和氨基酸序列相似性分别为89.6%~100%和92.7%~100%。在系统进化树中，本研究所获序列与 Badnavirus病毒的亲缘关系相对较近，聚在同一簇，表明此病毒为 Badnavirus 属病毒，但与芋杆状病毒（Taro bacilliform virus，TaBV）序列相似性较低，核苷酸和氨基酸相似性分别为58.0%~62.2%和58.5%~64.1%，推测为杆状DNA病毒属的一个新种。根据所测定序列设计了用于该病毒检测的引物P197/P433，对51份芋样品检测结果表明，该引物可有效检测来源于我国芋的 Badnavirus 病毒。 |
| 关 键 词： | 芋 杆状DNA病毒 PCR 序列分析 |
Molecular identification and specific detection of Badnavirus from taro grown in China |
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| Shi ming,WANG Yan fen,WANG Guo ping,WANG Li ping,XU Wen xing,HONG.Molecular identification and specific detection of Badnavirus from taro grown in China[J].Acta Phytopathologica Sinica,2013,43(6):590-595. | |
| Authors: | Shi ming WANG Yan fen WANG Guo ping WANG Li ping XU Wen xing HONG |
| Institution: | 1 College of Plant Science and Technology, Key Lab of Crop Disease Monitoring and Safety Control in Hubei, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China; 2National Key Lab of Agromicrobiology, Huazhong Agricultural University , Wuhan 430070, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | taro Badnavirus PCR sequence analysis |
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