| 麻鸭和樱桃谷鸭的CD3ε、CD4、CD8α基因ORF克隆及序列分析 |
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| 引用本文： | 李卫,白家媛,许媛媛,谷长勤,张万坡,程国富,陈敏,胡薛英.麻鸭和樱桃谷鸭的CD3ε、CD4、CD8α基因ORF克隆及序列分析[J].中国农业科学,2009,42(12):4428-4434. |
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| 作者姓名： | 李卫 白家媛 许媛媛 谷长勤 张万坡 程国富 陈敏 胡薛英 |
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| 作者单位： | 华中农业大学动物医学院,武汉,430070 |
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| 摘 要： | 【目的】分析比较中国部分品种鸭的CD3ε、CD4和CD8α基因ORF序列,为研究CD3ε链、CD4和CD8α链的结构和功能及其抗体的应用提供依据。【方法】利用RT-PCR,对麻鸭、樱桃谷鸭的CD3ε、CD4和CD8α基因ORF序列克隆测定,应用ClustalX（1.83）和DNAstar生物学软件分别与GenBank上公布的北京鸭CD3ε（AF378704）、CD4（AF378701）和CD8α（AF378373）基因ORF序列进行序列分析。【结果】麻鸭、樱桃谷鸭、北京鸭CD3ε和CD4基因ORF序列及所编码的氨基酸同源性为99%;北京鸭和麻鸭CD8α基因ORF序列同源性为99%,与樱桃谷鸭的同源性为95%。麻鸭和北京鸭CD8α基因ORF序基因编码的氨基酸完全一致,与樱桃谷鸭的CD8α存在16处位点差异,其中胞外区有15个氨基酸的差异,使亲水性、抗原性以及此区域位于蛋白质表面的可能性都有明显差异。从遗传发生树得出樱桃谷鸭、北京鸭、麻鸭CD3ε和CD4的ORF序列相互之间的遗传关系近;樱桃谷鸭、麻鸭和北京鸭CD8α基因ORF序列之间的遗传关系较远。【结论】樱桃谷鸭、北京鸭、麻鸭CD3ε和CD4的ORF序列遗传变异性低,樱桃谷鸭与麻鸭和北京鸭CD8α基因ORF之间具有较高遗传变异性。
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| 关 键 词： | CD3ε CD4 CD8α 序列分析 同源性 |
| 收稿时间： | 2009-07-20; |
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