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林木植物的全基因组选择
摘    要:基因组选择(GS,也称全基因组选择)是利用捕捉到一个乃至多个数量性状大多数基因位点的全基因组标记估计基因组育种值(即所有标记效应的总和),并以此对目标性状进行选择的方法。目前,这种新的选择方法正在给家畜育种实践带来一场革命性的变化。同样的方法和设想也适用于林木育种。事实上,漫长的世代时间以及大多数复杂性状晚期表达的特性历来都是林木育种所面临的巨大困难和挑战。不仅如此,林木植物还具备诸多其它的有利条件有助于GS的开展和应用,例如:易于收集并建立较大的参考群体且某些性状已作过准确的表型分析;一些改良群体的连锁不平衡(LD)程度较高,这其中包括林木高世代育种程序中所常用到的一些有效群体大小(Ne)较小的群体。本研究利用确定性方程就LD(通过Ne和标记间距离进行模拟),训练集的大小,性状遗传力,以及数量性状位点(QTL)的数目等因素对GS的预期准确性的影响进行了分析评估。结果显示,GS有可能使树木育种的有效性得到根本性的提高。当Ne≤30时,即便标记密度仅大约2个标记/厘摩(cM),采用GS就能达到传统BLUP(最佳线性无偏预测)选择的基准精度。不过,当Ne较大时,标记密度则需达到20个标记/cM。采用GS可使育种周期缩短50%,进而使育种效率增加100%或以上。随着技术的快速进步和基因分型成本的下降,我们谨慎而乐观地看好GS在加速树木育种进程和提高育种效率上的巨大潜力。不过,在将此项技术推广应用之前,尚需作进一步的模拟研究及概念验证试验。

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