| ‘库尔勒香梨’miR159家族成员进化特性及表达分析 |
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| 引用本文： | 马丽,周丽,徐航,全绍文,杨洁萍,牛建新.‘库尔勒香梨’miR159家族成员进化特性及表达分析[J].果树学报,2019(1). |
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| 作者姓名： | 马丽 周丽 徐航 全绍文 杨洁萍 牛建新 |
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| 作者单位： | 石河子大学农学院园艺系.特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室 |
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| 摘 要： | 【目的】了解‘库尔勒香梨’miR159家族成员的进化特征及其在萼片脱落与宿存中的作用。【方法】以‘库尔勒香梨’Small RNA高通量测序中获得的miR159家族前体序列和成熟体序列为基础进行系统发育树构建、前体和成熟体的序列比对、前体二级结构预测、WebLogo保守性分析、靶基因预测和表达量分析。【结果】‘库尔勒香梨’miR159家族存在2个前体成员(psi-MIR159a、psi-MIR159c)和2个成熟体成员(psi-miR159a、psi-miR159c)。2个前体成员的序列均能形成典型稳定的茎环结构,且序列完全一致,它们的最小折叠自由能(dG)都为-93.95 kal·mol~(-1)。系统发育进化树显示,‘库尔勒香梨’和苹果MIR159家族亲缘关系很近。WebLogo分析表明,miR159家族成熟体的保守性很高,其保守序列为5'-UUUGGAUUGAAGGGAGCUCUAUU-3',但‘库尔勒香梨’的碱基保守性较低。靶基因预测显示,‘库尔勒香梨’miR159基因家族靶基因为转录因子bHLH91、BES1/BZR1同源蛋白4、热激70 ku蛋白质、Trihelix转录因子GT-1、G型凝集素S-受体类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶RLK1等。实时荧光定量PCR(qPCR)显示,‘库尔勒香梨’miR159家族的2个成员在初花期、盛花期和末花期3个时期萼片脱落组和宿存组的表达量有显著差异。【结论】‘库尔勒香梨’miR159家族在进化过程中既有保守性又有多样性,可能在萼片脱落过程中起作用。
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| 关 键 词： | ‘库尔勒香梨’ miR159家族 进化特性 表达模式 |
Evolutionary characteristics and the expression patterns of miR159 gene family in 'Kuerlexiangli' pear |
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