| 黑紫色叶紫薇品种‘赤红’叶片转录组测序及注释分析 |
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| 引用本文： | 刘玉军,秦波,李媚,黄耀恒,刘芳,黄欣,刘莉.黑紫色叶紫薇品种‘赤红’叶片转录组测序及注释分析[J].湖南农业科学,2024(1):1-6. |
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| 作者姓名： | 刘玉军 秦波 李媚 黄耀恒 刘芳 黄欣 刘莉 |
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| 作者单位： | 1. 南宁树木园;2. 广西壮族自治区林业科学研究院,广西特色经济林培育与利用重点实验室 |
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| 摘 要： | 对黑紫色叶紫薇品种‘赤红’叶片进行高通量测序，并利用Trinity(2.8.6)对测序数据进行从头组装，共获得23 791条unigene，其中91.86%的序列在NR、GO、COG、KEGG等5大数据库中得到注释；NR数据库比对到的unigene数量最多，占比91.93%，随后依次为SWISS(67.95%)、COG(60.43%)、GO(51.37%)和KEGG(35.43%)。在NR数据库中，‘赤红’紫薇所有的unigene仅比对到1个物种——石榴（Punica granatum L.），表明同属于千屈菜科的紫薇和石榴亲缘关系较近。从转录组中共筛选到4 775个SSR位点，包括6种核苷酸重复类型，其中A/T和AG/CT类型占比最高。对色素合成相关通路基因进行分析，共挖掘到18个与类黄酮和花青素相关的基因，其中花青素合成通路中的UGT79B1、BZ1、UGT75C1可能是‘赤红’紫薇形成紫黑色叶的关键基因。
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| 关 键 词： | 紫薇品种‘赤红’ 转录组 基因注释 色素合成关键基因 |
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