| 大豆EST-SSR标记开发及与Genomic-SSR的比较研究* |
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| 引用本文： | 常玮,赵雪,李侠,邱波,韩英鹏,藤伟丽,李文滨.大豆EST-SSR标记开发及与Genomic-SSR的比较研究*[J].中国油料作物学报,2009,31(2):149-156. |
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| 作者姓名： | 常玮 赵雪 李侠 邱波 韩英鹏 藤伟丽 李文滨 |
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| 作者单位： | 1东北农业大学大豆研究所（国家教育部大豆生物学重点实验室）哈尔滨 150030
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划)，国家高技术研究发展计划(863计划)，国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 本研究对458220条大豆EST序列进行SSR搜索，共检测出EST-SSR序列39989条, 经拼接得到无冗余EST-SSR序列8190条，包括357种重复基元。其中二、三核苷酸重复基元类型居多，分别占无冗余EST总数的11.13%和16%，统计得到二核苷酸重复类型12种，三核苷酸重复类型60种。以含有简单重复序列的无冗余EST序列设计200对引物，其中148对引物有清晰且单一条带扩增产物，以30份大豆品种资源进行引物筛选，获得多态性引物31对。以21份大豆不同基因型的基因组DNA为模板选取30对显示多态性的大豆EST-SSR引物和30对大豆基因组SSR引物进行扩增，带型统计结果显示：大豆EST-SSR与基因组SSR在供试基因型间多态性指数均值分别为0.55 和0.44，二者揭示的多态性水平差异不大。从而说明利用生物信息学方法基于大豆EST开发SSR标记是切实可行的，大豆EST-SSR可以用于大豆遗传多样性分析，是大豆DNA分子标记体系的一个重要补充。
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| 关 键 词： | 大豆 EST-SSR 生物信息 多态性 |
Development of soybean EST-SSR marker and comparison with genomic-SSR marker |
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| CHANG Wei,ZHAO Xue,LI Xia,QIU Bo,HAN Ying-peng,TENG Wei-li,LI Wen-bin.Development of soybean EST-SSR marker and comparison with genomic-SSR marker[J].Chinese Journal of Oil Crop Sciences,2009,31(2):149-156. |
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| Authors: | CHANG Wei ZHAO Xue LI Xia QIU Bo HAN Ying-peng TENG Wei-li LI Wen-bin |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | EST-SSR |
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