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生物信息学对扩展莫尼茨绦虫cDNA文库Cavβ基因分析与B细胞抗原表位预测
引用本文:赵文娟,康立超,王正荣,薄新文,王新华.生物信息学对扩展莫尼茨绦虫cDNA文库Cavβ基因分析与B细胞抗原表位预测[J].新疆农业科学,2012,49(4):735-742.
作者姓名:赵文娟  康立超  王正荣  薄新文  王新华
作者单位:新疆农垦科学院/新疆兵团绵羊繁育生物技术重点实验室,新疆石河子,832000
基金项目:国家重点基础研究发展计划前期研究专项(2006CB708512);新疆生产建设兵团杰出青年创新资金专项(2011CD005);家畜疫病病原生物学国家重点实验室开放基金课题(SKLVEB2011KFKT008)
摘    要:目的]分离和鉴定扩展莫尼茨绦虫(Moniezia expansa)电压门控钙通道β亚基(cavB)基因,预测蛋白二级结构和B细胞抗原表位,从而探讨Cavβ在寄生虫病治疗中所起的作用.方法]构建扩展莫尼茨绦虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行引物步移法测序,获取全长cDNA序列;采用生物信息学方法对其对应的蛋白进行二级结构和B细胞抗原表位的预测.结果]获得扩展莫尼茨绦虫Cavβ基因,全长946 bp,编码180个氨基酸,理论分子质量为19.788 8 kD,等电点为5.06,属于Ca_channel_B超家族.二级结构以无规则卷曲为主,结构预测存在4个可能的B细胞抗原表位.结论]研究对于扩展莫尼茨绦虫Cavβ基因的获得和B细胞抗原表位的预测,为该基因功能的试验性鉴定工作奠定了基础.

关 键 词:扩展莫尼茨绦虫  Cavβ  二级结构  B细胞抗原表位  功能预测
收稿时间:2012-04-25
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