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绒山羊RORα基因2种亚型的结构与进化分析
引用本文:吴江鸿,刘永志,孙海莲,张文广.绒山羊RORα基因2种亚型的结构与进化分析[J].中国农业大学学报,2012,17(4):110-117.
作者姓名:吴江鸿  刘永志  孙海莲  张文广
作者单位:1. 内蒙古农牧业科学院/中国科学院内蒙古草业研究中心,呼和浩特010031……l~…—……~……一.-一 内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室,呼和浩特010018
2. 内蒙古农牧业科学院/中国科学院内蒙古草业研究中心,呼和浩特010031……l~…—……~……一.-一
3. 内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室,呼和浩特,010018
基金项目:国家自然科学基金资助项目,国家科技支撑计划项目,科技部农业科技成果转化资金项目,国家农业产业体系项目
摘    要:为深入研究绒山羊RORα基因的结构及功能,利用cDNA末端快速扩增法(RACE)结合转录组获得了绒山羊(Capra hircus)维甲酸相关孤核受体(retinoic acid receptor-related orphan receptorα,RORα)基因的2个亚型:RORα1和RORα2(GenBank登录号分别是HM061155和HM358053)。序列分析表明,RORα1序列全长1 620bp,包括5′端非翻译区(untranslated region,UTR)29bp、3′端非翻译区211bp和开放阅读框(open reading frame,ORF)1 380bp,共编码459个氨基酸,分子质量约为52.3ku,理论等电点6.25。RORα2序列全长1 694bp,包括5′UTR 76bp、3′UTR 211bp和ORF 1 407bp,共编码468个氨基酸;与人RORα4的长度相同,相似性达99%,分子质量约为53.4ku,理论等电点为6.37。结果显示:1)RORα1氨基酸序列缺少大多数核受体具有的调节区(A/B区),预测的二级结构少一个β-折叠基序(YFV);2)RORα的DNA结合区到配体结合区部分属于纯化选择,A/B区在长度和序列方面变异都很大。

关 键 词:绒山羊  RORα基因  RACE  编码蛋白  进化
收稿时间:2012/1/8 0:00:00

Structure and evolution of two isoforms of RORα in cashmere goat
WU Jiang-hong,LIU Yong-zhi,SUN Hai-lian and ZHANG Wen-guang.Structure and evolution of two isoforms of RORα in cashmere goat[J].Journal of China Agricultural University,2012,17(4):110-117.
Authors:WU Jiang-hong  LIU Yong-zhi  SUN Hai-lian and ZHANG Wen-guang
Institution:1.Inner Mongolia Prataculture Research Center,Chinese Academy of Science, Inner Mongolia Academy of Agricultural & Animal Husbandry Sciences,Hohhot 010031,China; 2.Key Laboratory of Animal Genetics,Breeding and Reproduction,Inner Mongoial Autonomous Region,Hohhot 010018,China)
Abstract:
Keywords:Cashmere goat  RORα gene  RACE  encoding protein  evolution
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