| 牛SOCS5基因5′调控区多态性研究 |
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| 引用本文： | 杨永强,谢海强,刘彬,孙岩岩,赵顺林,肖希希,龚俞,焦仁刚,张依裕,刘若余.牛SOCS5基因5′调控区多态性研究[J].广西农业科学,2013(8):1362-1366. |
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| 作者姓名： | 杨永强 谢海强 刘彬 孙岩岩 赵顺林 肖希希 龚俞 焦仁刚 张依裕 刘若余 |
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| 作者单位： | [1]贵州大学动物科学学院／高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室债州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵阳550025 [2]贵州省畜牧技术推广站,贵阳550001 |
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| 基金项目： | 贵州省重大科技专项计划项目（黔科合重大专项字[2011]6009号）;贵州大学研究生创新基金项目（研农2013021） |
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| 摘 要： | 【目的】筛选SOCS5基因启动子区多态位点（SNP），并研究其对启动子功能元件的影响。【方法】选择贵州地方优良品种务川黑牛和中国荷斯坦奶牛两种生长性能差异明显的品种构建DNA池。直接测序后用DNASTAR软件进行序列拼接和校正，BLAST分析SOCS5基因多态性，然后用生物信息学软件预测序列核心启动子区和CpG岛，分析SNP位点对转录因子结合位点影响。【结果】牛SOC5基因5′调控区和第1外显子区存在3个SNP位点，分别为：C-577T、T-43C和C＋61T，其中C＋61T与SNP数据库中的rs110977810信息相符，C-577T和T-43C为新发现SNP位点。生物信息学软件预测得到SOCS5基因核心启动子区和CpG岛，SNP位点导致附近大量转录因子结合位点消失和新位点产生；SNP位点对转录因子结合位点有显著影响，但对核心启动子范围和起始位点无明显影响，不在甲基化水平上影响SOCS基因表达水平。【结论】牛SOCS5基因5′调控区存在3个对启动子功能元件有较大影响的SNP位点。
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| 关 键 词： | SOCS5基因 SNP位点 启动子 CpG岛 贵州务川黑牛 中国荷斯坦奶牛 |
Polymorphisms of 5′-flanking region of SOCS5 gene in cattle |
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| YANG Yong-qiang,XIE Hai-qiang,LIU Bin,SUN Yan-yan,ZHAO Shun-lin,XIAO Xi-xi,GONG Yu,JIAO Ren-gang,ZHANG Yi-yu,LIU Ruo-yu.Polymorphisms of 5′-flanking region of SOCS5 gene in cattle[J].Guangxi Agricultural Sciences,2013(8):1362-1366. |
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| Authors: | YANG Yong-qiang XIE Hai-qiang LIU Bin SUN Yan-yan ZHAO Shun-lin XIAO Xi-xi GONG Yu JIAO Ren-gang ZHANG Yi-yu LIU Ruo-yu |
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| Institution: | 1College of Animal Sciences, Guizhou University/Key Laboratory of Animal Genetics, Breeding and Reproduction in the Plateau Mountainous Region, Ministry of Education/Guizhou Key Laboratory of Animal Genetics, Breeding and Reproduction, Guiyang 550025, China; 2Guizhou Animal Science and Technology Station, Guiyang 550001, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | SOCS5 SNP promoter CpG island Wuchuan black cattle Chinese Holstein cow |
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