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| 全蛋白组水平预测旋毛虫分泌蛋白及其功能分析 | |
| 作者单位： | ;1.南京农业大学动物医学院 |
| 摘 要： | 从蛋白组水平预测并分析旋毛虫分泌蛋白的特征。利用软件预测旋毛虫蛋白组范围分泌蛋白,并统计和分析其序列特征,最后利用数据库信息注释分析分泌蛋白功能。结果:预测得到414个经典途径分泌蛋白和245个非经典途径分泌蛋白,占蛋白组2.40%。MEME统计经典分泌蛋白信号肽中存在可能的3个基序。氨基酸组成分析表明,旋毛虫分泌蛋白及其信号肽主要由疏水性氨基酸组成,而信号肽剪切位点主要由亲水性氨基酸组成,信号肽剪切位点-3和-1两个位点氨基酸保守性高,可能是相关酶识别关键点。在对分泌蛋白的功能进行注释分析中发现,与核酸酶活性和蛋白酶活性相关的蛋白比例较高。研究结果为旋毛虫致病机制的深入研究提供理论基础。 |
| 关 键 词： | 旋毛虫 蛋白组 预测 分泌蛋白 功能注释 |
A proteome-wide prediction and functional analysis of the secreted proteins in Trichinella spiralis |
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