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利用微滴数字PCR技术分析转基因大豆‘GE-J12’中外源基因的拷贝数
引用本文:赵新,刘双,刘娜,李瑞环,曹英芳,兰青阔,王永.利用微滴数字PCR技术分析转基因大豆‘GE-J12’中外源基因的拷贝数[J].中国农业大学学报,2022,27(1):58-66.
作者姓名:赵新  刘双  刘娜  李瑞环  曹英芳  兰青阔  王永
作者单位:天津市农业科学院 生物技术研究所, 天津 300384;河北农业大学 食品科技学院, 河北 保定 071001
基金项目:国家科技重大专项(2019ZX08004001-005)
摘    要:为鉴定抗除草剂转基因大豆新品种‘GE-J12’的外源基因插入拷贝数,以该转化体的外源插入目的基因G2-EPSPSGAT的序列、3′转化体特异性序列为靶序列,设计PCR扩增引物和TaqMan探针,并对引物探针特异性进行鉴定,同时以大豆内标基因Lectin为参照,建立微滴数字PCR拷贝数检测体系。特异性试验结果显示,只有以抗除草剂转基因大豆‘GE-J12’基因组DNA为模板才有扩增信号。以单株转基因大豆‘GE-J12’基因组DNA为模板,进行外源目的基因G2-EPSPSGAT、3′转化体特异性序列的微滴数字PCR检测,转基因大豆‘GE-J12’的外源目的基因G2-EPSPSGAT在基因组上的插入拷贝数均值分别为0.99和1.01。同时3′转化体特异性序列的拷贝数均值为1.00,验证单株转基因大豆‘GE-J12’为纯合子,因此鉴定该单株转基因大豆‘GE-J12’的外源基因在大豆基因组上为单拷贝插入,同时与Southern blot方法进行比较,结果一致。

关 键 词:拷贝数  微滴数字PCR  转基因大豆  外源基因
收稿时间:2021/1/6 0:00:00
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