| 我国近5年类NADC30 PRRSV毒株序列的重组及限制性片段长度多态性分析 |
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| 引用本文： | 王彪,谷尚品,侯晓璇,王孟月,王小娟,谭菲菲,田克恭.我国近5年类NADC30 PRRSV毒株序列的重组及限制性片段长度多态性分析[J].中国兽医学报,2023(8):1594-1603. |
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| 作者姓名： | 王彪 谷尚品 侯晓璇 王孟月 王小娟 谭菲菲 田克恭 |
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| 作者单位： | 1. 河南农业大学动物医学院;2. 国家兽用药品工程技术研究中心 |
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| 摘 要： | 为了解我国类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)毒株的流行和遗传变异情况，本研究利用生物信息学软件对本实验室2016-2020年获得的64条类NADC30毒株序列进行分析。Nsp2氨基酸序列比对结果表明，64株毒株均表现出与NADC30毒株一致的131个不连续的氨基酸缺失。其中，9株在Nsp2区域除该缺失特征外，另含有额外的氨基酸缺失。基于全基因组遗传演化分析结果表明，61株分布在Sublineage 1.8(类NADC30),3株分布在Lineage 8(HP-PRRSV)。而基于ORF5序列的遗传演化分析结果则更分散，56株分布在SubLineage 1.8,5株分布在Lineage 8,2株分布在Lineage 5(类VR2332),1株分布在Sublineage 1.5(类NADC34)。经RFP4和Simplot生物学软件进行重组分析结果表明，64株毒株中可能有44株为重组毒株，共表现出5种重组模式，其中以NADC30提供骨架，HP-PRRSV提供重组片段为主要模式。重组热点分布在非结构蛋白区域5′UTR～1 500 nt(Nsp1)、5 374～8 177 nt...
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| 关 键 词： | PRRSV 类NADC30 遗传演化分析 重组热点 RFLP |
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