鹅星状病毒辽宁株分离鉴定及遗传变异分析与抗原表位预测 |
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引用本文: | 周慧,高慎阳,李冰,董筱萍,孙弋雅,刘英姿,甄志刚,赵岩,刘丽颖,车立忱,周铁忠.鹅星状病毒辽宁株分离鉴定及遗传变异分析与抗原表位预测[J].中国兽医学报,2023(11):2243-2250. |
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作者姓名: | 周慧 高慎阳 李冰 董筱萍 孙弋雅 刘英姿 甄志刚 赵岩 刘丽颖 车立忱 周铁忠 |
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作者单位: | 1. 锦州医科大学畜牧兽医学院;2. 锦州市农业农村综合服务中心;3. 营口市动物疫病预防控制中心 |
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基金项目: | 辽宁省教育厅高等学校基本科研资助项目(202202006,202203001); |
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摘 要: | 从辽宁某鹅场无菌采集病死雏鹅肝脏、肾脏等病料,通过鹅胚接种、核酸检测、电镜观察等方法进行病原的分离鉴定,并对所分离的毒株进行遗传变异分析和抗原表位预测。经过接种病料鹅胚的病变特征观察、病毒PCR核酸扩增和序列分析以及透射电镜形态鉴定,确认成功分离到1株GAstV(goose astrovirus),暂命名GAstV/LN/202101(简称LN202101)。针对编码衣壳蛋白保守结构域N和P2 Capsid domain的核苷酸序列对该毒株进行遗传进化树和同源性分析,结果显示该毒株与江西株JX01(MZ576222.1)等近2年发现的毒株亲缘关系较近,在同一簇分支,且属于GAstV-Ⅱ型;但同源性已表现出差异。以HAstV(human astrovirus)已验证表位为参考,依据抗原抗体结合模型,结合生信方法推测以下4段序列可能为GAstV的抗原表位:453~467aa(PQADSRSRYNANITF)、508~513aa(VCNTLA)、525~553aa(TAVLRVNTSTTSTGGQITELRNRLNIADG)和585~597aa(DSNPGETFQSFKM)。结果表明,GAs...
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关 键 词: | 鹅星状病毒 辽宁分离株 变异分析 抗原表位 |
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