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番茄GRX基因家族的鉴定及表达分析
引用本文:苏慧慧,李涛,黎振兴,李植良,王永飞.番茄GRX基因家族的鉴定及表达分析[J].核农学报,2015,29(4).
作者姓名:苏慧慧  李涛  黎振兴  李植良  王永飞
作者单位:1. 暨南大学生命科学技术学院,广东广州510532;广东省农业科学院蔬菜研究所,广东广州510640
2. 广东省农业科学院蔬菜研究所,广东广州,510640
3. 暨南大学生命科学技术学院,广东广州,510532
摘    要:GRX基因家族是从原核生物到真核生物中普遍存在的一类巯基-二硫键氧化还原酶,在植物的生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中均发挥重要作用.本研究在番茄基因组范围内,利用生物信息学方法对番茄的GRX基因组家族的成员、分布及结构和功能等进行分析.预测结果显示,番茄GRX家族包含55个蛋白质,分为4个亚族,其中植物特有的CC亚族成员最多,有35个,其他GRX基因成员与拟南芥GRX家族具有相似分类.在番茄GRX结构域中包含12个重要的基序,主要分布在序列的N端,相同亚族中的GRX成员蛋白序列的氨基酸保守域构成基本一致,且各亚族成员的氨基酸保守域组成特异,表明这些基序的存在对GRX蛋白功能的执行是必需的.利用实时荧光定量PCR对番茄GRX基因的组织表达和胁迫响应分析,结果表明,GRX基因具有组织特异性表达差异,CC型在根和花中表达较高,在果实中表达较低;在盐、SA、ABA、高温和低温胁迫条件下,22个番茄GRX基因的表达模式被阐明;其中部分基因的表达水平被显著地诱导增加或者降低,很可能参与了调控番茄逆境胁迫条件下的防御应答反应.本研究结果将为番茄GRX家族基因的深入研究提供依据,为进一步解析GRX基因功能奠定基础.

关 键 词:番茄  GRX基因家族  生物信息学  表达分析

Identification and Gene Expression Analysis of GRX Gene Family in Tomato
SU Huihui,LI Tao,LI Zhenxing,LI Zhiliang,WANG Yongfei.Identification and Gene Expression Analysis of GRX Gene Family in Tomato[J].Acta Agriculturae Nucleatae Sinica,2015,29(4).
Authors:SU Huihui  LI Tao  LI Zhenxing  LI Zhiliang  WANG Yongfei
Abstract:
Keywords:tomato  Glutaredoxins family  bioinformatics  gene expression
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