鸡传染性支气管炎病毒(IBV)广西流行株3'端非编码区序列分析 |
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引用本文: | 磨美兰,范文胜,黄柏成,郎亚辉,陈秋英,侯金莲,李孟,韦平,韦天超.鸡传染性支气管炎病毒(IBV)广西流行株3'端非编码区序列分析[J].广西农业生物科学,2010(3):457-463. |
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作者姓名: | 磨美兰 范文胜 黄柏成 郎亚辉 陈秋英 侯金莲 李孟 韦平 韦天超 |
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作者单位: | 广西大学动物科学技术学院,南宁530005 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(30700599); 广西自然科学基金(桂科青0728003和桂科自0991044); 广西科技攻关项目(0993009-2); 广西高等学校优秀人才资助项目(桂教人才0802)共同资助 |
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摘 要: | 本研究应用RT-PCR方法扩增出分离自广西的26株鸡传染性支气管炎病毒(IBV)以及参考株M41和疫苗株H120、Ma5和4/91的3'端非编码区(3'UTR)的cDNA,并对其进行了克隆、序列测定、比较及其系统进化分析。序列分析结果表明,与Beaudette株的3'UTR序列相比较,26株分离的IBV中有1株和3株的分离株3'UTR序列分别插入了23个和2个碱基,另外有12株、6株、1株、2株和1株的分离株3'UTR序列分别缺失了1个、2个、22个、29个和84个碱基,不同毒株之间碱基数量最大相差达107个碱基。系统进化分析结果表明,26株分离株可分为4群,其中21株属于第Ⅰ群,与经典疫苗株H120的核苷酸同源性均较低(54.4%~75.5%);3株与4/91同属于第Ⅱ群;1株与H120同属于第Ⅲ群;另外1株单独属于Ⅴ群。综上所述,广西流行IBV的绝大部分毒株在3'UTR序列上与目前常用的疫苗株相比都发生了很大的变异,而且存在多种形式的碱基缺失和插入现象。由此,我们认为流行株的变异可能是疫苗不能提供有效保护的主要原因。
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关 键 词: | 鸡传染性支气管炎病毒 3'端非编码区 系统进化分析 基因缺失 基因插入 |
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