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我国苏南地区美洲鲥7个养殖群体的遗传多样性分析
引用本文:李玉林,罗明坤,冯冰冰,朱文彬,傅建军,梁政远,解旭东,缪凌鸿,董在杰.我国苏南地区美洲鲥7个养殖群体的遗传多样性分析[J].上海海洋大学学报,2024,33(2).
作者姓名:李玉林  罗明坤  冯冰冰  朱文彬  傅建军  梁政远  解旭东  缪凌鸿  董在杰
作者单位:南京农业大学 无锡渔业学院,中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室,江苏省渔业技术推广中心,中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室,中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室,南京农业大学 无锡渔业学院;无锡瑞顺水产养殖科技有限公司,镇江欣润农业发展有限公司,中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室,南京农业大学 无锡渔业学院;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室
基金项目:江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目(JBGS[2021]131); 江苏现代农业产业技术体系建设(JATS[2022]370)
摘    要:为探讨苏南地区美洲鲥(Alosa sapidissima)养殖群体的种质资源现状及遗传多样性水平,本研究采用15个微卫星标记和线粒体D-loop序列,对7个不同群体:镇江丹徒(Dtq)、镇江扬中(Yzq)、苏州张家港(Zjg)、苏州相城(Xcq)、南通中洋(Zyq)、常州滆湖(Ghq)和常州武进(Czq)共计210尾个体,进行了群体多样性分析。结果显示,15个SSR位点中除Asa-12外,其余位点均表现为高度多态性(PIC > 0.5)。其中,7个群体期望杂合度He为0.615~0.758,多态信息含量PIC为0.568~0.723,两者均以Zjg群体最高。D-loop序列共检测到32个变异位点,定义了20个单倍型,其中Zjg群体单倍型最多(11个)。7个群体的单倍型多样性、核苷酸多样性指数分别为0.618~0.945、0.003~0.008。基于SSR和D-loop序列的遗传距离分析,发现Ghq群体和Zyq群体的Nei’s遗传距离(0.058)和K2P遗传距离(0.003)最近,低于其他群体间的遗传距离(分别为0.073~0.397和0.003~0.006)。综合分析,我们发现7个美洲鲥群体的遗传多样性较为丰富,而群体间遗传变异程度不高,基因流Nm > 1和镶嵌式排列的个体进化树也证实7个群体的亲缘关系较近。基于本研究,可初步了解苏南地区鲥的种质现状,为后续进一步开展育种工作奠定理论基础。

关 键 词:美洲鲥  微卫星  D-loop区  遗传多样性
收稿时间:2023/4/17 0:00:00
修稿时间:2023/8/22 0:00:00

Genetic diversity analysis of seven American shad (Alosa sapidissima) populations in southern Jiangsu, China
LI Yulin,LUO Mingkun,FENG Bingbing,ZHU Wenbin,FU Jianjun,LIANG Zhengyuan,XIE Xudong,MIAO Linghong and DONG Zaijie.Genetic diversity analysis of seven American shad (Alosa sapidissima) populations in southern Jiangsu, China[J].Journal of Shanghai Ocean University,2024,33(2).
Authors:LI Yulin  LUO Mingkun  FENG Bingbing  ZHU Wenbin  FU Jianjun  LIANG Zhengyuan  XIE Xudong  MIAO Linghong and DONG Zaijie
Abstract:
Keywords:Alosa sapidissima  Microsatellite  D-loop  Genetic diversity
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