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基于Cytb基因的江苏省大银鱼种群遗传多样性和遗传结构分析
引用本文:李大命,唐晟凯,刘燕山,谷先坤,刘小维,殷稼雯,张彤晴,潘建林.基于Cytb基因的江苏省大银鱼种群遗传多样性和遗传结构分析[J].上海海洋大学学报,2021,30(3):416-425.
作者姓名:李大命  唐晟凯  刘燕山  谷先坤  刘小维  殷稼雯  张彤晴  潘建林
作者单位:江苏省淡水水产研究所 江苏省内陆水域渔业资源重点实验室, 江苏 南京 210017
基金项目:江苏省水生生物资源重大专项(ZYHB16-3)
摘    要:为了解江苏省湖泊大银鱼(Protosalanx hyalocranius)种群遗传多样性及遗传结构,基于PCR扩增与测序技术对太湖、高邮湖、洪泽湖和骆马湖等4个群体共160尾大银鱼的线粒体Cytb基因序列进行分析。结果显示,160条Cytb基因序列共发现25个变异位点,其中单一信息位点11个,简约信息位点14个。4个群体中共检测到23个单倍型,单倍型和核苷酸多样性分别为0.878±0.014和0.002 1±0.000 1,呈现出高单倍型多样性和低核苷酸多样性模式。4个群体中,高邮湖群体的单倍型多样性最高(0.871±0.031),太湖群体的核苷酸多样性最高(0.002 9±0.000 1)。洪泽湖群体的单倍型和核苷酸多样性均最低,分别为0.755±0.455和0.001 3±0.000 1。分子方差分析结果显示,大银鱼群体间的遗传变异占15.13%,群体内的遗传变异占84.87%,遗传变异主要发生在群体内。遗传分化指数Fst值统计表明:高邮湖、洪泽湖和骆马湖群体之间无显著性差异,但均与太湖群体存在显著性差异,应将太湖群体与其他3个群体作为不同的进化单元进行管理和保护。核苷酸不配对分布和中性检验结果均显示大银鱼经历了近期的群体扩张事件,推测扩张时间在10.3万~4.1万年前,属于更新世晚期。虽然江苏省4个湖泊大银鱼种群的遗传多样性较高,但其资源量已经呈现出明显衰退迹象,应加强相应的渔业管理和保护措施,合理开发和利用大银鱼资源,做到可持续发展。

关 键 词:大银鱼  细胞色素b基因  遗传多样性  种群结构
收稿时间:2019/7/4 0:00:00
修稿时间:2020/3/5 0:00:00

Genetic diverisity and population structure of Protosalanx hyalocranius in Jiangsu Province based on Cytb gene sequences
LI Daming,TANG Shengkai,LIU Yanshan,GU Xiankun,LIU Xiaowei,YIN Jiawen,ZHANG Tongqing,PAN Jianlin.Genetic diverisity and population structure of Protosalanx hyalocranius in Jiangsu Province based on Cytb gene sequences[J].Journal of Shanghai Ocean University,2021,30(3):416-425.
Authors:LI Daming  TANG Shengkai  LIU Yanshan  GU Xiankun  LIU Xiaowei  YIN Jiawen  ZHANG Tongqing  PAN Jianlin
Institution:Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Key Laboratory of Fisheries Resources in Inland Water of Jiangsu Province, Nanjing 210017, Jiangsu, China
Abstract:
Keywords:Protosalanx hyalocranius  Cytb gene  genetic diversity  population structure
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