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香菇SSR—PCR技术体系的优化及其在遗传多样性分析中的初步应用
作者姓名:肖扬  李黎  吴茜  边银丙
作者单位:华中农业大学应用真菌研究所,武汉,430070 ?
基金项目:农业部公益性行业(农业)科研专项项目,教育部农学教学实验用微生物菌种资源标准化整理、整合及共享试点资助项目?
摘    要:为建立稳定的香菇SSR技术体系,采用L16(45)正交试验设计,对影响香菇SSR-PCR的主要因素进行了优化筛选,建立了最佳的反应体系.在20μl反应体系中,包含1.5 mmol/L Mg2+,75 ng模板DNA,0.25 mmol/L dNTPs.0.50 μmoI/L引物及1.5U Taq酶.梯度PCR试验筛选得到相应引物的最佳退火温度为62℃.以该体系为基础,应用5对引物扩增8个香菇菌株的基因组DNA,扩增条带清晰稳定,聚类分析结果能较好地反映供试菌株的地理来源关系.以0.5的相似性为分割点,8个菌株可分成2大类群.类群Ⅰ主要由北方菌株组成,类群Ⅱ由南方菌株组成.该研究为SSR标记技术在香菇分子生物学研究方面的应用奠定了基础.

关 键 词:香菇  正交设计  体系优化  聚类分析

Optimization of SSR-PCR Technological System and Its Preliminary Application to Genetic Diversity Analysis for Lentinula edodes
Authors:Xiao Yang  Li Li  Wu Qian  Bian Yinbing
Abstract:
Keywords:SSR-PCR
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