| 锌胁迫下甘蓝型油菜发芽期下胚轴长的全基因组关联分析 |
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| 引用本文： | 魏丽娟,申树林,黄小虎,马国强,王曦彤,杨怡玲,李洹东,王书贤,朱美晨,唐章林,卢坤,李加纳,曲存民.锌胁迫下甘蓝型油菜发芽期下胚轴长的全基因组关联分析[J].作物学报,2021(2):262-274. |
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| 作者姓名： | 魏丽娟 申树林 黄小虎 马国强 王曦彤 杨怡玲 李洹东 王书贤 朱美晨 唐章林 卢坤 李加纳 曲存民 |
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| 作者单位： | 西南大学农学与生物科技学院/油菜工程研究中心/西南大学现代农业科学研究院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31701460);中央高校基本科研业务费(XDJK2019C041,XDJK2020D023);重庆市基础科学与创新研究项目(cstc2016shms-ztzx80010,cstc2017jcyjAX0321);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-12);高等学校学科创新引智基地111项目(B12006)资助 |
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| 摘 要： | 锌(Zn)是重要的微量元素之一,但土壤中过量的锌累积会影响植物的生长发育。本研究以不同遗传来源的140份甘蓝型油菜为材料,利用芸薹属60K SNP芯片对锌胁迫下(30 mg L-1)甘蓝型油菜发芽期相对下胚轴长(RHL)进行全基因组关联分析,筛选与甘蓝型油菜发芽期下胚轴长度显著关联的SNP位点及候选基因。群体结构分析表明,供试的140份甘蓝型油菜被分为2个亚群,其中89%材料间亲缘关系小于0.1,说明供试群体材料亲缘关系比较远。GWAS分析共检测到8个与RHL显著关联的SNP位点,单个SNP位点分别可解释22.0%~33.2%的表型变异。转录组分析获得的差异基因GO富集分析结果表明,上调表达基因主要参与氧化还原反应、离子转运、胁迫反应、防御反应和硫化合物转运。综合全基因组关联分析和转录组测序结果,共鉴定到19个与锌胁迫相关的候选基因,包括编码锌指蛋白家族成员(B-box型和ZFP1)、谷胱甘肽转移酶GSTU21、过氧化物酶家族蛋白、ABC和MFS转运蛋白及细胞壁相关激酶蛋白和一些重要的转录因子(BnaA07g27330D、BnaA02g30270D、BnaA07g27840D、BnaA07g31860D和BnaA07g28000),为深入解析油菜锌胁迫分子机制提供了参考。
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| 关 键 词： | 甘蓝型油菜 重金属 锌胁迫 全基因组关联分析 发芽期 |
Genome-wide association analysis reveals zinc-tolerant loci of rapeseed at germination stage |
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| WEI Li-Juan,SHEN Shu-Lin,HUANG Xiao-Hu,MA Guo-Qiang,WANG Xi-Tong,YANG Yi-Ling,LI Huan-Dong,WANG Shu-Xian,ZHU Mei-Chen,TANG Zhang-Lin,LU Kun,LI Jia-Na,QU Cun-Min.Genome-wide association analysis reveals zinc-tolerant loci of rapeseed at germination stage[J].Acta Agronomica Sinica,2021(2):262-274. |
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| Authors: | WEI Li-Juan SHEN Shu-Lin HUANG Xiao-Hu MA Guo-Qiang WANG Xi-Tong YANG Yi-Ling LI Huan-Dong WANG Shu-Xian ZHU Mei-Chen TANG Zhang-Lin LU Kun LI Jia-Na QU Cun-Min |
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| Institution: | (College of Agronomy and Biotechnology,Southwest University/Chongqing Engineering Research Center for Rapeseed/Academy of Agricultural Sciences,Southwest University,Chongqing 400715,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Brassica napus heavy metal zinc stress GWAS germination stage |
| 本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录！ |
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