| 螺旋藻基因组中糖苷酶类基因的序列分析 |
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| 引用本文： | 戴世鲲,何 慧,李 涛,吴华莲,向文洲,曾海心.螺旋藻基因组中糖苷酶类基因的序列分析[J].广东农业科学,2016,43(12):115-121. |
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| 作者姓名： | 戴世鲲 何 慧 李 涛 吴华莲 向文洲 曾海心 |
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| 作者单位： | 中国科学院南海海洋研究所/中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室,广东广州,510301 |
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| 基金项目： | 海南省科技兴海专项(2015XH04)，广东省海洋渔业科技与产业发展专项(A201501C09) |
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| 摘 要： | 在NCBI基因组数据库中可检索到3个钝顶螺旋藻藻株、1个极大螺旋藻藻株、1个盐泽螺旋藻藻株和1个螺旋藻属未定种的藻株基因组序列。6个螺旋藻基因组序列来源的糖苷酶基因共计32个,编码蛋白含260~1 084个氨基酸,BLAST序列比对显示,与非螺旋藻种属来源的已知序列的相似性在49%~84%之间。系统进化分析表明,32个糖苷酶基因聚类成8个簇,另有3个基因分别单独构成进化分支。酶学功能预测显示,这些糖苷酶基因分别属于8个糖苷酶家族(GH3、GH9、GH13、GH23、GH25、GH38、GH57、GH104),具有8种糖苷酶催化活性(纤维素酶、溶菌酶、α-甘露糖苷酶、α-淀粉酶、普鲁兰酶、1,4-α-葡聚糖分支酶、肽聚糖结合功能、β-葡萄糖苷酶)。
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| 关 键 词： | 螺旋藻 基因组 糖苷酶 |
Sequence analysis of glycosidase genes in Spirulina (Arthrospira) genome |
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