| 牙鲆精氨酸酶基因片段的克隆及序列分析 |
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| 引用本文： | 刘 华,施婷婷,施志仪.牙鲆精氨酸酶基因片段的克隆及序列分析[J].广东农业科学,2016,43(12):108-114. |
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| 作者姓名： | 刘 华 施婷婷 施志仪 |
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| 作者单位： | 1. 南宁富莱欣生物科技有限公司研发中心,广西南宁,530003;2. 上海海洋大学生物技术研究中心,上海,200090 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(30271017)，国家高等教育博士项目科研基金(20040264001) |
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| 摘 要： | 根据Gen Bank中虹鳟、大菱鲆、斑马鱼及其他生物的精氨酸酶基因序列设计并合成一对引物,并提取变态期牙鲆仔鱼总RNA作为模板进行RT-PCR,得到一条c DNA片段。将产物连接到T载体中,转化、扩增重组质粒。提取大肠杆菌中的重组质粒进行DNA测序。将DNA测序所得到的基因序列翻译成蛋白序列和已知的大菱鲆、鲤鱼、虹鳟、斑马鱼的精氨酸酶基因序列进行同源性分析。结果显示,利用RTPCR的方法扩增出一条284 bp的目的基因片段,比对结果发现,其与大菱鲆、鲤鱼、斑马鱼以及虹鳟精氨酸酶基因蛋白序列的同源性分别为96%、85%、84%和82%。对蛋白序列进行生物信息学分析发现,整个蛋白序列中无信号肽,无糖基化位点,无跨膜结构域,但含有一个典型的arginase结构。在N-端第38~44、57~64、71~76、89~94区段有β-折叠中心;第7~18、50~52、81~87区段可能形成α螺旋区域。Arg蛋白N端第37~45和第74~77区段为优势抗原表位区域。
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| 关 键 词： | 牙鲆 精氨酸酶 克隆 序列分析 |
Cloning and sequencing of gene fragments of
Paralichthys olivaceus arginase |
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| Keywords: | |
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