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斑节对虾泛素融合蛋白UbL40 基因 的克隆及表达分析
引用本文:傅明骏,吴 松,唐 蕾,周发林,邱丽华,江世贵.斑节对虾泛素融合蛋白UbL40 基因 的克隆及表达分析[J].广东农业科学,2016,43(4):144-150.
作者姓名:傅明骏  吴 松  唐 蕾  周发林  邱丽华  江世贵
作者单位:1. 中国水产科学研究院南海水产研究所/农业部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东广州510300;中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心,海南三亚572028;2. 中国水产科学研究院南海水产研究所/农业部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东广州510300;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;3. 中国水产科学研究院南海水产研究所/农业部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东广州510300;华南农业大学动物科学学院,广东广州510642;4. 中国水产科学研究院南海水产研究所/农业部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东广州,510300
基金项目:国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-47),广东省科技计划项目(2013B040402016;2014A020208039),海南省自然科学基金(20163147),中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2014TS12)
摘    要:从斑节对虾(Penaeus monodon)肝胰腺转录组数据中筛选获得泛素融合蛋白Ub L40基因(ubiquitin/ribosomal L40 fusion protein,Pm Ub L40)的部分序列,利用RACE技术克隆其c DNA全长序列,通过生物信息学进行结构分析;利用实时定量PCR技术检测该基因在斑节对虾不同组织及卵巢不同发育期的表达情况。结果表明,Pm Ub L40基因c DNA全长571 bp,开放阅读框(Open reading frame,ORF)长390 bp,编码129个氨基酸,预测分子量约14.7 ku,理论等电点为9.76。预测氨基酸序列的N-末端(1~76aa)为高度保守的泛素结构域,C-末端(77~129aa)为典型的核糖体蛋白L40结构域。多重序列比对表明不同物种的Ub L40在进化过程中高度保守。实时定量PCR结果显示Pm Ub L40基因在肝胰腺的表达量最高,肌肉、卵巢次之,其他组织的表达较低;在卵巢发育过程中Pm Ub L40基因在II期表达最高,其次是V期,显著高于I、III、IV期。研究结果表明Pm Ub L40基因在斑节对虾卵巢发育过程中可能具有重要作用。

关 键 词:斑节对虾  泛素融合蛋白L40  卵巢发育  基因克隆

Molecular characterization and expression profiles of UbS27 gene from black tiger shrimp (Penaeus monodon)
Abstract:
Keywords:
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