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大鼠RVLG选择性剪接变异体的鉴定和分析
引用本文:黄文强,董珍珍,邢万金.大鼠RVLG选择性剪接变异体的鉴定和分析[J].中国农业科学,2011,44(7):1474-1480.
作者姓名:黄文强  董珍珍  邢万金
作者单位:内蒙占大学生命科学学院/哺乳动物生殖生物学与生物技术教育部重点实验室,呼和浩特,010021
基金项目:国家自然科学基金,国家基础科学人才培养基金,国家大学生创新基金
摘    要:目的]确认大鼠RVLG(rat vasa-Iike gene)的第7、8两个内含子的部分片段在卵巢中可能存在选择性剪接现象,进一步检测大鼠RVLG的第7、8两个内含子在卵巢和睾丸中的选择性剪接形式.方法]从雌雄各5只Wistar大鼠的卵巢和睾丸组织中提取总RNA,反转录成cDNA后作为模板,用PCR扩增RVLG起始密码后约620-690 bp的编码区cDNA.分别选卵巢和睾丸各7个独立克隆测序,将测序结果与大鼠RVL6基因组DNA比对,分析是否有选择性剪接.结果]大鼠卵巢和睾丸组织中各7个RVLG cDNA 编码区5'端620-690 bp的片段测序结果均存在45 bp和15 bp两处选择性剪接.在7个卵巢RVLG cDNA独立克隆中,有5个仅存45 bp而缺少15 bp,两个仅存15 bp而缺少45 bp;7个睾丸RVLG cDNA独立克隆中,4个仅存在45 bp而缺少15 bp,两个既含有15bp又含有45 bp,一个既没有45 bp也没有15 bp.经与大鼠RVLG基因组DNA序列比对后确认45 bp位于其第7内含子5'端的两个GT之间,15 bp位于第8内含子3'端的两个AG之间,剪掉或保留这两段均符合典型的GT-AG内含子剪接原则,属选择性剪接.结论]大鼠RVLG的第7、8两个内含子在卵巢和睾丸中均存在多种选择性剪接形式,体内的标准剪接方式应该是第7外显子3'端保留45 bp,第9外显子不保留来自第8内含子的15 bp.

关 键 词:RVLG    RT-PCR    选择性剪接
收稿时间:2010-06-27

Identification and Characterization of the Alternative Splicing Variants of Rat RVLG
HUANG Wen-qiang,DONG Zhen-zhen,XING Wan-jin.Identification and Characterization of the Alternative Splicing Variants of Rat RVLG[J].Scientia Agricultura Sinica,2011,44(7):1474-1480.
Authors:HUANG Wen-qiang  DONG Zhen-zhen  XING Wan-jin
Institution:Key Laboratory of Mammalian Reproduction Biology and Technology of Ministry of Education/School of Life Sciences, Inner Mongolia University, 010021
Abstract:
Keywords:RVLC  RT-PCR
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