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毛白杨木材形成功能基因内SSR标记的开发及评价
引用本文:杜庆章,王博文,王保垒,张曼,李百炼,张志毅,张德强.毛白杨木材形成功能基因内SSR标记的开发及评价[J].林业科学,2010,46(11).
作者姓名:杜庆章  王博文  王保垒  张曼  李百炼  张志毅  张德强
基金项目:中央高校基本科研业务费专项资金,国家自然科学基金,教育部科学技术研究重大项目,全国百篇优秀博士论文专项基金,教育部新世纪优秀人才支持计划专项基金,国家林业局948项目
摘    要:利用直接测序法开发木材形成功能基因内一套新的核基因组SSR标记.通过对参与木材形成的16个基因在40个毛白杨基因型个体中的序列比较分析,共检测剑20个SSR多态性位点.在毛白杨自然群体中,SSR多态性位点的碱基重复呈现出二碱基、三碱基、五碱基、六碱基与七碱基形式,基元霞复次数变异范围为2~34次,其中以二碱基重复的位点较多,占总数的55.0%.在此基础上,依据SSR位点两侧的保守序列,设计20对SSR位点PCR扩增引物对.利用设计的引物检测开发的SSR位点在杨属内15个基因型个体中PCR扩增的有效性及SSR位点的保守性.PCR扩增结果显示,90.0%的SSR位点能够在杨属至少2个派内有效扩增,每对引物组合可检测到SSR多样性位点数为3~9个,平均5.3个.开发的这些SSR位点在功能基因内小同区域的分布频率不同.

关 键 词:毛白杨  木材形成  基于基因的SSR标记

Development and Evaluation of Simple Sequence Repeat(SSR)Loci from Functional Genes Involved in Wood Formation in Populus tomentosa
Du Qingzhang,Wang Bowen,Wang Baolei,Zhang Man,Li Bailian,Zhang Zhiyi,Zhang Deqiang.Development and Evaluation of Simple Sequence Repeat(SSR)Loci from Functional Genes Involved in Wood Formation in Populus tomentosa[J].Scientia Silvae Sinicae,2010,46(11).
Authors:Du Qingzhang  Wang Bowen  Wang Baolei  Zhang Man  Li Bailian  Zhang Zhiyi  Zhang Deqiang
Abstract:
Keywords:
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