动物性中药材地龙DNA条形码初步研究 |
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引用本文: | 吕国庆,牛宪立,姬可平.动物性中药材地龙DNA条形码初步研究[J].广东农业科学,2011,38(17). |
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作者姓名: | 吕国庆 牛宪立 姬可平 |
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作者单位: | 1. 遒义医学院珠海校区.广东珠海519041 2. 遵义医学院珠海校区生化与细胞分子生物学教研室,广东珠海,519041 |
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摘 要: | 利用通用引物对中药材地龙的COI、16S rDNA片断进行PCR扩增、测序、分析,并构建系统进化树,将获得的中药材地龙CO Ⅰ、16S rDNA片断序列提交到GenBank中的DNA Barcoding数据库进行分析.结果显示:(1) 中 药材地龙CO Ⅰ片断的长度为682 bp.其中变异位点(SNP多态位点)有179个,多态位点约占片断总长的26%.碱基A+T的含量为58.8%、G+C的含量为41.2%.16S rDNA片断的长度为503 bp.其中变异位点有70个,多态位点约占片断总长的14%,碱基A+T的含量为62.4%、G+C的含量为37.6%;(2)获得CO Ⅰ序列的登录号为HQ405769-HQ405776,16s rDNA序列的登录号为HQ405777 -HQ405783;(3)中药材地龙DNA中CO Ⅰ序列的基因多态性比16S rDNA序列更显著,适合做为中药材地龙的DNA条形码.
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关 键 词: | 中药材 地龙 DNA条形码 线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ基因(COI) 16S rRNA基因(16S rDNA) |
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