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达乌尔黄鼠线粒体Cyt b基因序列特征及其系统进化分析
引用本文:王静,纪维红,徐长林,苏军虎.达乌尔黄鼠线粒体Cyt b基因序列特征及其系统进化分析[J].草原与草坪,2016(3):17-22.
作者姓名:王静  纪维红  徐长林  苏军虎
作者单位:1. 兰州职业技术学院,甘肃兰州,730070;2. 甘肃农业大学草业学院/草业生态系统教育部重点实验室/甘肃省草业工程实验室/中-美草地畜牧业可持续发展研究中心,甘肃兰州 730070;甘肃农业大学-新西兰梅西大学草地生物多样性研究中心,甘肃兰州 730070;Institute of Natural and Mathematical Sciences,Massey University,Private Bag 102 904 North Shore Mail Centre 0632, Auckland, New Zealand;3. 甘肃农业大学草业学院/草业生态系统教育部重点实验室/甘肃省草业工程实验室/中-美草地畜牧业可持续发展研究中心,甘肃兰州,730070;4. 甘肃农业大学草业学院/草业生态系统教育部重点实验室/甘肃省草业工程实验室/中-美草地畜牧业可持续发展研究中心,甘肃兰州 730070;甘肃农业大学-新西兰梅西大学草地生物多样性研究中心,甘肃兰州 730070
基金项目:兰州市农业攻关项目“兰州市农田害鼠(达乌尔黄鼠)监测及防控技术研究”(2013-4-131),甘肃省高校科研项目“药用动物鼢鼠(塞隆骨)DNA条码形筛选及鉴定研究”(2015A-205)
摘    要:在甘肃省天祝藏族自治县采集12只达乌尔黄鼠(Spermophilus dauricus),PCR产物直接测序获得Cyt b基因1140bp序列,采用Clustal X 1.84、MEGA 6.0、Dna SP 5.0等生物信息学软件进行了序列特征和系统地位分析。结果显示,达乌尔黄鼠Cyt b基因含116个多态信息位点,群体中多态位点类型有转换、颠换,Cyt b基因T,C,A,G碱基含量分别为33.7%,25.9%,27.6%,12.9%。基于Kimura双参数的遗传距离显示,属内种间大黄鼠(Spermophilus major)与新疆黄鼠(Spermophilus fulvus)间遗传距离最小(0.034),高加索黄鼠(Spermophilus musicus)与达乌尔黄鼠最大(0.172),达乌尔黄鼠群体内遗传距离为0.140,种群分化较大,基于NJ法构建的系统进化树符合传统分类标准,研究为达乌尔黄鼠Cyt b基因标记的种群遗传学应用提供了参考。

关 键 词:达乌尔黄鼠  线粒体  遗传多样性  Cyt  b

Sequence analysis of mitochondrial Cyt b gene and evolutionary relationships of Spermophilus dauricus
WANG Jing,JI Wei-hong,XU Chang-lin,SU Jun-hu.Sequence analysis of mitochondrial Cyt b gene and evolutionary relationships of Spermophilus dauricus[J].Grassland and Turf,2016(3):17-22.
Authors:WANG Jing  JI Wei-hong  XU Chang-lin  SU Jun-hu
Abstract:
Keywords:Spermophilus dauricus  mitochondrial  evolutionary relationships  Cyt b
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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