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| 五个地方绵羊品种FAS基因3′-UTR区单核苷酸多态性研究 | |
| 引用本文： | 杨具田,徐红伟,臧荣鑫,蔡勇,卢建雄,曹忻,霍生东,刘根娣,吴建平 .五个地方绵羊品种FAS基因3′-UTR区单核苷酸多态性研究[J].中国农业科学,2010,43(13). |
| 作者姓名： | 杨具田 徐红伟 臧荣鑫 蔡勇 卢建雄 曹忻 霍生东 刘根娣 吴建平 |
| 作者单位： | （甘肃农业大学动物科学技术学院） |
| 摘 要： | 【目的】探究脂肪酸合成酶(FAS)基因3′端非翻译区(3′-UTR)在绵羊地方品种中的遗传多态性,为进一步揭示地方绵羊品种间遗传分化、开展肉质性状的关联分析和表达调控等研究提供依据。【方法】采用PCR-SSCP和DNA测序技术对兰州大尾羊(38只)、滩羊(58只)、甘加羊(40只)、欧拉羊(30只)和乔科羊(39只)五个地方绵羊品种205只个体的脂肪酸合成酶(FAS)基因3′-UTR进行单核苷酸多态性(SNPs)检测和遗传多态性分析。【结果】在这五个地方绵羊品种的FAS基因3′-UTR区中,有951位点和1005位点2个多态位点;两位点分别存在AA、Aa、aa和EE、Ee、ee各三种基因型,而aa和ee基因型未检测到;AA和EE基因型频率高于Aa和Ee基因型频率,基因型AA和EE为优势基因型;A和E两个等位基因频率高于a和e等位基因频率,为优势等位基因。适合性检验表明,这5个地方绵羊品种在951位点和1005位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。独立性检验表明:在951位点,兰州大尾羊与滩羊、欧拉羊、甘加羊和乔科羊之间表现为差异显著(0.01P0.05);滩羊与欧拉羊、甘加羊和乔科羊之间表现为差异极显著(P0.01);欧拉羊、甘加羊和乔科羊,甘加羊与乔科羊均表现为差异不显著(P0.05);在1005位点兰州大尾羊、滩羊、欧拉羊、甘加羊和乔科羊品种之间均表现为差异不显著(P0.05)。测序结果表明,951位点在FAS基因在其转录产物mRNA的951位所对应处有一处C→T突变;1005位点在FAS基因在其转录产物mRNA的1005位所对应处有一处A→G突变。FAS基因mRNA二级结构预测结果显示:951位点的突变能导致其二级结构发生了明显的改变,而1005突变不会改变其二级结构。【结论】五个地方绵羊品种在FAS基因3′-UTR区有951位点(C→T)和1005位点(A→G)两个SNPs,2位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态;基因型频率分布的独立性检验结果表明,在951位点,兰州大尾羊与滩羊、欧拉羊、甘加羊和乔科羊之间表现为差异显著(0.01P0.05);滩羊与欧拉羊、甘加羊和乔科羊之间表现为差异极显著(P0.01);欧拉羊与甘加羊和乔科羊、甘加羊与乔科羊均表现为差异不显著(P0.05);在1005位点兰州大尾羊、滩羊、欧拉羊、甘加羊和乔科羊品种之间均表现为差异不显著(P0.05)。 |
| 关 键 词： | 绵羊 脂肪酸合成酶基因 单核苷酸多态性 |
| 收稿时间： | 2010-01-22; |
Polymorphism of 3′-UTR of Fatty Acid Synthase (FAS) Gene in Five Chinese Sheep Breeds |
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| YANG Ju-tian,XU Hong-wei,ZANG Rong-xin,CAI Yong,LU Jian-xiong,CAO Xin,HUO Sheng-dong,LIU Gen-di,WU Jian-ping .Polymorphism of 3′-UTR of Fatty Acid Synthase (FAS) Gene in Five Chinese Sheep Breeds[J].Scientia Agricultura Sinica,2010,43(13). |
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| Authors: | YANG Ju-tian XU Hong-wei ZANG Rong-xin CAI Yong LU Jian-xiong CAO Xin HUO Sheng-dong LIU Gen-di WU Jian-ping |
| Institution: | (College of Animal Science and Technology of Gansu Agricultural University) |
| Abstract: | |
| Keywords: | sheep FAS gene PCR-SSCP |
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