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草鱼基因组中微卫星分子标记的制备及筛选
引用本文:马海涛,鲁翠云,于冬梅,孙效文.草鱼基因组中微卫星分子标记的制备及筛选[J].上海海洋大学学报,2007(4):389-393.
作者姓名:马海涛  鲁翠云  于冬梅  孙效文
作者单位:[1]中国水产科学研究院,黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨150070 [2]大连水产学院,辽宁大连116023
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划);国家公益性计划
摘    要:采用新型的生物素-磁珠吸附微卫星富集法与传统的放射性同位素杂交法相结合的方式,研究了草鱼(Ctenopharyngodon idella)基因组中存在的微卫星资源.结果,从1 000个细菌中,挑出90个阳性克隆,把其中45个进行测序分析,在这些序列中共含有68个微卫星核心序列,有55个含有重复次数大于5次的微卫星核心序列.其中,单一型标记49个,占72%,包括CA重复单元共22个,GT重复单元共18个,其他重复单元为9个;在72%的单一型标记中,完美单一型微卫星标记为44个,占65%.另外,混合型标记共19个,13为完美混合型;在所有微卫星标记中,CA重复类型最普遍,依次为GT、GA等.在68个微卫星标记中,有15个依据引物设计原理设计了引物.

关 键 词:草鱼  生物素  磁珠  微卫星
修稿时间:2006/7/10 0:00:00

Microsatellite enrichment by magnetic beads in grass carp (Ctenopharyngodon idella)
MA Hai-tao,LU Cui-yun,YU Dong-mei,SUN Xiao-wen.Microsatellite enrichment by magnetic beads in grass carp (Ctenopharyngodon idella)[J].Journal of Shanghai Ocean University,2007(4):389-393.
Authors:MA Hai-tao  LU Cui-yun  YU Dong-mei  SUN Xiao-wen
Institution:1. Heilongjiang River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fisheries Sciences, Harbin 150070, China; 2. Dalian Fisheries University, Dalian 116023, China
Abstract:
Keywords:grass carp(Ctenopharyngodon idella)  biotin  magnetic beads  microsatellite
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