鸡肾型传染性支气管炎病毒IBV-SD04株M基因克隆与序列分析 |
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引用本文: | 陈冰,李云霞,孙美玉,王寿山,李亚杰,郁宏伟,杨保收.鸡肾型传染性支气管炎病毒IBV-SD04株M基因克隆与序列分析[J].中国家禽,2014,36(20). |
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作者姓名: | 陈冰 李云霞 孙美玉 王寿山 李亚杰 郁宏伟 杨保收 |
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作者单位: | 天津瑞普生物技术股份有限公司研究院,农业部生物兽药创制重点实验室,天津300308 |
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基金项目: | 瑞普生物研究院动物疫病流行病学调查专项基金 |
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摘 要: | IBV-SD04(以下简称SD04株)为一株临床分离的鸡肾型传染性支气管炎病毒.通过RT-PCR技术扩增出该毒株的M基因片段,并将其克隆到pMD-18T载体中进行序列测定与分析,结果表明该分离株M基因长度为678 bp,编码225个氨基酸,与国内外主要的疫苗毒株和国内分离株核苷酸同源性为86.6%~99.9%;通过DNAStar软件对M蛋白进行二级结构预测,结果表明M蛋白的N端前98位氨基酸具有良好的亲水性、抗原性指数以及表面可能性;通过在线软件TMHMM Server v.2.0对M蛋白进行跨膜区分析,结果显示SD04株M蛋白跨膜3次,跨膜区分别位于23 ~40、47~69和79~98肽段区;应用在线软件NetNGlyc 1.0和NetOGlyc 3.1对M蛋白进行糖基化位点分析,结果表明SD04株M蛋白无氧连糖基化位点,存在2个氮连糖基化位点.综合以上信息,SD04株可作为疫苗候选株进行研究.
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关 键 词: | 鸡肾型传染性支气管炎病毒 M基因 克隆 序列分析 |
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