牛病毒性腹泻病毒基因Ⅱ型HLJ-10分离株全基因组克隆及其序列特征分析 |
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引用本文: | 刘华,付培芬,李岩,温凯,贾莹,刘晓玫,张海丽,商云鹏,高明春,马波,张文龙,王君伟.牛病毒性腹泻病毒基因Ⅱ型HLJ-10分离株全基因组克隆及其序列特征分析[J].中国预防兽医学报,2012(1):24-27. |
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作者姓名: | 刘华 付培芬 李岩 温凯 贾莹 刘晓玫 张海丽 商云鹏 高明春 马波 张文龙 王君伟 |
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作者单位: | 东北农业大学动物医学院 |
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基金项目: | 现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-37) |
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摘 要: | 为研究牛病毒性腹泻病毒(BVDV)的分子特征,本研究参考GenBank中登录的BVDV基因Ⅱ型病毒株全基因组序列,设计多对引物,通过RT-PCR方法,对一株分离自某商品化血清中的BVDV分离株HLJ-10全基因组进行分段克隆及序列测定,获得了该分离株的全基因组序列。生物信息学分析表明,该分离株为BVDV基因Ⅱ型,全长12 284 nt,编码区为11 694 nt,共编码3 897个氨基酸,5’和3’非编码区分别为385 nt和205 nt。与其它BVDV参考株序列比对分析表明,HLJ-10与SH-28和KZ91CP进化关系较密切,预测该分离株含有22个潜在糖基化位点,氨基酸差异性分析表明E2蛋白的氨基酸序列在瘟病毒属中变异性较大。
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关 键 词: | 牛病毒性腹泻病毒 基因组 序列分析 |
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