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牛病毒性腹泻病毒基因Ⅱ型HLJ-10分离株全基因组克隆及其序列特征分析
引用本文:刘华,付培芬,李岩,温凯,贾莹,刘晓玫,张海丽,商云鹏,高明春,马波,张文龙,王君伟.牛病毒性腹泻病毒基因Ⅱ型HLJ-10分离株全基因组克隆及其序列特征分析[J].中国预防兽医学报,2012(1):24-27.
作者姓名:刘华  付培芬  李岩  温凯  贾莹  刘晓玫  张海丽  商云鹏  高明春  马波  张文龙  王君伟
作者单位:东北农业大学动物医学院
基金项目:现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-37)
摘    要:为研究牛病毒性腹泻病毒(BVDV)的分子特征,本研究参考GenBank中登录的BVDV基因Ⅱ型病毒株全基因组序列,设计多对引物,通过RT-PCR方法,对一株分离自某商品化血清中的BVDV分离株HLJ-10全基因组进行分段克隆及序列测定,获得了该分离株的全基因组序列。生物信息学分析表明,该分离株为BVDV基因Ⅱ型,全长12 284 nt,编码区为11 694 nt,共编码3 897个氨基酸,5’和3’非编码区分别为385 nt和205 nt。与其它BVDV参考株序列比对分析表明,HLJ-10与SH-28和KZ91CP进化关系较密切,预测该分离株含有22个潜在糖基化位点,氨基酸差异性分析表明E2蛋白的氨基酸序列在瘟病毒属中变异性较大。

关 键 词:牛病毒性腹泻病毒  基因组  序列分析
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